Специфичная и эффективная доставка веществ из внеклеточного пространства, а также между компартментами клетки является основной задачей везикулярного транспорта и осуществляется специализированной транспортной системой. Одним из подходов к изучению механизмов везикулярного транспорта является анализ изображений, получаемых с помощью лазерной сканирующей конфокальной микроскопии. Выбор программы для анализа конфокальных изображений представляет собой нетривиальную задачу. Целью работы являлось исследование транспорта эндосом и анализ колокализации белка EEA1 с белками EGFR и Rab5 в клетках HeLa при эндоцитозе по конфокальным изображениям. Были адаптированы три разных программы анализа колокализации белков и получены количественные характеристики колокализации этих белков в нормальных условиях и в условиях стимуляции эндоцитоза в присутствии и отсутствии ингибитора брефельдина А. В ходе сравнения полученных результатов с экспертными данными были сделаны выводы о применимости используемых программ. Полученные результаты свидетельствуют о важной роли биосинтетического пути образования EEA1-везикул.