В работе было изучено влияние пептида EDR на экспрессию сигнальных молекул в нейронах при старении. Также были исследованы ДНК-пептидные взаимодействия методом молекулярного моделирования (MOE 2014). В качестве маркеров функциональной активности нейронов при их старении исследовали экспрессию молекул p53, p21, p16, AIF, Sirt6, Ku70, Ku80 в культурах клеток коры головного мозга. Синтетический пептид EDR уменьшал уровень апоптоза в культуре клеток нейронов крысы при старении, снижая экспрессию маркеров апоптоза p53, p21, AIF, и повышал уровень интенсивности клеточного обновления в культурах нейронов при их старении, увеличивая экспрессию маркеров клеточной пролиферации Sirt6, Ku80. С помощью конформационного анализа была найдена энергетически выгодная конформация пептида EDR, методом молекулярного докинга был предсказан предпочтительный сайт связывания GCCG, расположенный в промоторной области генов, продуктами которых являются изученные сигнальные молекулы.

The effect of peptide EDR on the expression of signaling molecules in neurons was studied during aging. Moreover, molecular modeling methods (MOE 2014) were used to investigate the DNA-peptide interactions. The expression of molecules p53, p21, p16, AIF, Sirt6, Ku70, Ku80 in cortex cell cultures was revealed as markers of functional activity of neurons during their aging. The synthetic peptide EDR reduced apoptosis in neuronal cell culture in aging rats via decreasing the expression of markers of apoptosis p53, p21, AIF, and increased the cell renewal rate in neuronal cultures during their aging via increasing the expression of markers of cell proliferation Sirt6, Ku80.The energetically favorable conformation of peptide EDR was found using conformational analysis, the preferred binding site GCCG located in promoter region of genes was predicted by molecular docking method for peptide EDR. The studied signaling molecules are the products of the investigated genes.