Детальная информация

Название: Адаптация инструмента поиска мутаций в геноме для технологии Spark: магистерская диссертация: 09.04.01
Авторы: Осенняя Дарья Игоревна
Научный руководитель: Дробинцев Павел Дмитриевич
Организация: Санкт-Петербургский политехнический университет Петра Великого. Институт компьютерных наук и технологий
Выходные сведения: Санкт-Петербург, 2016
Коллекция: Выпускные квалификационные работы; Общая коллекция
Тематика: Вычислительные машины электронные — Применение в биологии и медицине; биоинформатика; геномика; поиск мутаций; bioinformatics; genomics; variant calling
УДК: 004.9:57(043.3)
Тип документа: Выпускная квалификационная работа магистра
Тип файла: PDF
Язык: Русский
Уровень высшего образования: Магистратура
Код специальности ФГОС: 09.04.01
Группа специальностей ФГОС: 090000 - Информатика и вычислительная техника
DOI: 10.18720/SPBPU/2/v16-2299
Права доступа: Доступ по паролю из сети Интернет (чтение, печать, копирование)
Ключ записи: RU\SPSTU\edoc\35124

Разрешенные действия:

Действие 'Прочитать' будет доступно, если вы выполните вход в систему или будете работать с сайтом на компьютере в другой сети Действие 'Загрузить' будет доступно, если вы выполните вход в систему или будете работать с сайтом на компьютере в другой сети

Группа: Анонимные пользователи

Сеть: Интернет

Аннотация

Данная диссертация посвящена адаптации инструмента поиска мутаций в геноме для его совместного использования с технологией Apache Spark. Описана предметная область, обоснована актуальность инструментов поиска мутаций и необходимость ускорения их работы. Приведён обзор инструментов для поиска мутаций, а также обзор технологии Apache Spark. Разработана и описана методика перевода инструмента поиска мутаций на Spark. Разработанная методика была реализована в инструменте VarDictSpark. Приведены графики сравнения производительности модифицированного и исходного инструментов.

Права на использование объекта хранения

Место доступа Группа пользователей Действие
Локальная сеть ИБК СПбПУ Все Прочитать Печать Загрузить
Интернет Авторизованные пользователи СПбПУ Прочитать Печать Загрузить
-> Интернет Анонимные пользователи

Статистика использования

stat Количество обращений: 168
За последние 30 дней: 0
Подробная статистика