Детальная информация

Осенняя, Дарья Игоревна. Адаптация инструмента поиска мутаций в геноме для технологии Spark [Электронный ресурс]: магистерская диссертация: 09.04.01 / Д. И. Осенняя; Санкт-Петербургский политехнический университет Петра Великого, Институт компьютерных наук и технологий ; науч. рук. П. Д. Дробинцев. — Электрон. текстовые дан. (1 файл : 2,62 МБ). — Санкт-Петербург, 2016. — Загл. с титул. экрана. — Свободный доступ из сети Интернет (чтение). — Текстовый файл. — Adobe Acrobat Reader 7.0. — <URL:http://elib.spbstu.ru/dl/2/v16-2299.pdf>. — <URL:http://doi.org/10.18720/SPBPU/2/v16-2299>.

Дата создания записи: 20.12.2016

Тематика: Вычислительные машины электронные — Применение в биологии и медицине; биоинформатика; геномика; поиск мутаций; bioinformatics; genomics; variant calling

УДК: 004.9:57(043.3)

Коллекции: Выпускные квалификационные работы; Общая коллекция

Ссылки: DOI

Разрешенные действия: Прочитать Для чтения документа необходим Flash Player

Группа: Анонимные пользователи

Сеть: Интернет

Аннотация

Данная диссертация посвящена адаптации инструмента поиска мутаций в геноме для его совместного использования с технологией Apache Spark. Описана предметная область, обоснована актуальность инструментов поиска мутаций и необходимость ускорения их работы. Приведён обзор инструментов для поиска мутаций, а также обзор технологии Apache Spark. Разработана и описана методика перевода инструмента поиска мутаций на Spark. Разработанная методика была реализована в инструменте VarDictSpark. Приведены графики сравнения производительности модифицированного и исходного инструментов.

Права на использование объекта хранения

Место доступа Группа пользователей Действие
Локальная сеть ИБК СПбПУ Все Прочитать
-> Интернет Все Прочитать

Статистика использования документа

stat Количество обращений: 141
За последние 30 дней: 2
Подробная статистика