В работе рассмотрены основы налогового контроля в Российской Федерации, описаны этапы налогового контроля, дан анализ сильных и слабых сторон методов и инструментов различных видов налогового контроля. На основании данных бухгалтерского и налогового учета предприятий, результатов проведения предпроверочного анализа и выездных налоговых проверок осуществлён анализ эффективности методики проведения предпроверочного анализа и даны предложения по её улучшению и введению новых показателей оценки рисков уклонения от налогообложения. Проведена оценка эффективности усовершенствованной методики предпроверочного анализа, сделаны выводы по результатам нововведений.