Details

Title: Изменчивость генов F и G штаммов респираторно-синцитиального вируса человека, выделенных в 2014-2016 годах в С.-Петербурге: магистерская диссертация: 16.04.01
Creators: Синцова Ксения Сергеевна
Scientific adviser: Грудинин М. П.
Organization: Санкт-Петербургский политехнический университет Петра Великого. Институт физики, нанотехнологий и телекоммуникаций
Imprint: Санкт-Петербург, 2017
Collection: Выпускные квалификационные работы; Общая коллекция
Subjects: вирусы; секвенирование; филогенетический анализ; дыхательные пути
UDC: 616.214.7(043.3); 578.7(043.3)
Document type: Master graduation qualification work
File type: PDF
Language: Russian
Level of education: Master
Speciality code (FGOS): 16.04.01
Speciality group (FGOS): 160000 - Физико-технические науки и технологии
DOI: 10.18720/SPBPU/2/v17-2533
Rights: Доступ по паролю из сети Интернет (чтение, печать, копирование)
Record key: RU\SPSTU\edoc\40197

Allowed Actions:

Action 'Read' will be available if you login or access site from another network Action 'Download' will be available if you login or access site from another network

Group: Anonymous

Network: Internet

Annotation

Настоящая диссертация посвящена изучению штаммов респираторно-синцитиального вируса человека, циркулировавших на территории Российской Федерации в 2014-2016 годах. Оценена изменчивость F-гена 24 изолятов РСВ, выделенных в Санкт-Петербурге в 2014 - 2016 гг., которые были отнесены к антигенной группе А (РСВ-А). По классификации, основанной на анализе структуры G-гена, все они принадлежат к генотипу ON1, отличительным признаком которого является инсерция 72 нуклеотидов в G-гене и который в настоящее время является доминирующим среди РСВ, циркулирующих во многих странах. С учетом результатов секвенирования F-гена в соответствии с критериями, предложенными в 2016 г. Кимурой с соавторами, большинство выделенных штаммов (кроме пяти не классифицируемых) были отнесены к генотипу GA2, для которого характерны аминокислотные замены (по сравнению со штаммом Long) V384I и N276S. Анализ мутаций F-гена позволил разделить выделенные нами РСВ на 2 группы. Большая часть оказалась близка к современным штаммам 2013-2017гг, информация о которых представлена в базе данных GenBank, и референсному вирусу генотипа ON1, далеко отойдя от вирусов-прародителей Long и А2. Пять штаммов, полученных в С.-Петербурге в 2014 г., составили особую «архаичную» группу, у которых структура F-белка приближена к вирусу Long. При сравнении с РСВ Long у всех исследованных изолятов была выявлена высокая частота замен во многих функционально значимых антигенных сайтах F-белка.

Document access rights

Network User group Action
ILC SPbPU Local Network All Read Print Download
Internet Authorized users SPbPU Read Print Download
-> Internet Anonymous

Usage statistics

stat Access count: 351
Last 30 days: 0
Detailed usage statistics