Table | Card | RUSMARC | |
Allowed Actions: –
Action 'Read' will be available if you login or access site from another network
Action 'Download' will be available if you login or access site from another network
Group: Anonymous Network: Internet |
Annotation
В представленной работе рассматривается усовершенствование утилиты сортировки генетической информации в проекте с открытым исходным кодом SAMtools. Проведено исследование новых алгоритмов, подходов векторизации и параллелизации с целью выбора наилучшей модификации для внедрения в код официального репозитория. В результате были разработаны алгоритмы поразрядной сортировки и сети сортировки, производительность которых лучше исходного варианта по разным оценкам от 3 до 9 раз. Обозначены перспективы векторизации разработанных методов. Реализация поразрядной сортировки была принята в исходный код официального репозитория SAMtools и успешно применяется при работе с генетическими данными в области медицины и биоинформатики.
Document access rights
Network | User group | Action | ||||
---|---|---|---|---|---|---|
ILC SPbPU Local Network | All | |||||
Internet | Authorized users SPbPU | |||||
Internet | Anonymous |
Usage statistics
Access count: 243
Last 30 days: 0 Detailed usage statistics |