Работа посвящена теоретико-методологической разработке оценки инновационного потенциала развития региона, с дальнейшим анализом и принятия мер по стратегии развития региона. Развитие современного мира во многом определяет эффективность и активность инновационного процесса. Конкурентоспособность экономики страны зависит, прежде всего, от этого фактора. Россия, к сожалению, с большим отставанием входит в структуру мировых тенденций современного мирохозяйственного развития. В связи с этим, в первой главе данной работы будут рассмотрены особенности инновационного развития СЗФО. Во второй главе будут рассмотрены теоретические основы управления формированием инновационного потенциала. Ознакомимся с ключевыми факторами формирования инновационного потенциала развития регионов. А так же будет проведен анализ методик оценки инновационного потенциала развития в регионе. В третьей главе будут разработаны рекомендации для структурной оценки инновационного потенциала регионов. Будет приведен анализ оценки инновационного потенциала СЗФО.