Объектом исследования является внешнеэкономическая деятельность Томской области РФ. Предметом исследования выступает стратегия развития внешнеэкономической деятельности Томской области РФ. Цель исследования - это разработка стратегии внешнеэкономической деятельности Томской области РФ, наиболее учитывающий стратегические преимущества региона. На основе анализа внешнеэкономической деятельности, а также институциональной среды Томской области в целом, были выделены стратегические преимущества региона – человеческий капитал, природные ресурсы, наличие высокотехнологичных промышленных кластеров и развитой инновационной инфраструктуры; его слабые стороны – удаленность от основных транспортных магистралей и др., и потенциал к развитию с точки зрения внешнеэкономической деятельности. Была разработана и решена трехуровневая эконометрическая модель в рамках институционально-функционального подхода, отражающая взаимодействие производства, институциональной среды и внешнеэкономической деятельности. Результаты решения модели и содержательного анализа позволили выбрать оптимальную стратегию внешнеэкономической деятельности Томской области, для которой был разработан план мероприятий по реализации и меры контроля.