В диссертационном исследовании приводится теоретическое обоснование и разработка научно-практических рекомендаций по оценке эффективности инновационного промышленного производства биотоплива с учетом рисков. В работе рассматриваются основные тенденции развитии мирового топливно-энергетического рынка, проводится подробный анализ широко применяемых альтернативных источников энергии, определяются перспективы развития биотоплива и сопутствующие экономические проблемы, определяются методы поддержки биотопливной промышленности, а также рассматриваются последствия развития биотопливной промышленности для российской энергетики. Автор приводит классификацию факторов успешной реализации инновационного проекта, модель оценки величины финансового резерва предприятия при создании промышленного комплекса по производству биотоплива, а также многокритериальную оценка эффективности инновационного проекта с использованием шкалы Харрингтона. На основе проведенной работы разрабатывается методика комплексной оценки инновационного промышленного производства биотоплива, а так же проводится апробация методики оценки эффективности инновационного проекта (на примере проекта по производству биоэтанола в Алтайском крае).