Реализован метод анализа молекулярных колебаний, основанный на вычислении Фурье-спектра частот суперкомпьютерных амплитудно-временных реализаций интегрального дипольного момента при суперкомпьютерном моделировании аминокислот глицина, дифенил-L-аланина и триптофана. Спектры верифицированы путем сопоставления с известными литературными данными квантовохимических вычислений, компьютерного моделирования и экспериментальной спектроскопии. Показано, что предложенные комплекс и методика позволяют эффективно вычислять достоверные спектры локальных колебаний атомной подсистемы молекулы. Полученные результаты полезны при разработке прототипов гибридных полупроводниковых микроэлектронных приборов с встроенными биомолекулярными компонентами.

In order to analyze molecular vibrations, a method based on the calculation of the Fourier frequency spectrum of supercomputer amplitude-time realizations of the integral dipole moment in supercomputer simulation of glycine, Diphenyl-L-alanine, and tryptophan has been implemented. Under conditions of a zero external electromagnetic field, the frequency spectra of natural local vibrations of the atomic subsystem of the molecule were established to be the results of spectral analysis of these realizations. The spectra were verified by comparison with the known literature data on quantum chemical computing, computer simulation and experimental spectroscopy. It was shown that the proposed complex and technique made it possible to efficiently calculate reliable spectra of local amino acid vibrations. The results obtained may be useful for the development of prototypes of hybrid semiconductor microelectronic devices with built-in biomolecular components.

Научно-технические ведомости Санкт-Петербургского государственного политехнического университета. Сер.: Физико-математические науки. — Санкт-Петербург: СПбПУ, 2019 -. — Электрон. журнал. — Периодичность: 4 раза в год. — Выходит с 07.2019. — Свободный доступ из сети Интернет (чтение, печать, копирование). — Текст: электронный

Научно-технические ведомости Санкт-Петербургского государственного политехнического университета. Сер.: Физико-математические науки. — Санкт-Петербург: СПбПУ, 2019 -. Т. 15, № 4, 2022. — 1 файл (11,4 Мб). — Свободный доступ из сети Интернет (чтение, печать, копирование). — <URL:http://elib.spbstu.ru/dl/2/j23-165.pdf>.