Работа посвящена проблеме управления интеллектуальным капиталом научно-производственных организаций (НПО) в процессе их перехода к использованию цифровых технологий. В рамках исследования решен ряд задач, в том числе: расширен понятийный аппарат в сфере теории управления (предложены определения интеллектуального капитала (ИК) и механизма управления интеллектуальным капиталом в период цифровизации); доказано, что при освоении цифровых технологий в НПО необходимы специальные условия, обеспечивающие развитие ИК (рейтинговая оценка, финансовое обеспечение, система управления сопротивлением персонала, корпоративная культура, формулировка миссии, стратегические цели); предложены инструменты оценки интеллектуального капитала НПО в процессе цифровизации; разработаны методические рекомендации по анализу результатов оценки ИК; представлена система управления ИК НПО на основе организационно-экономического механизма, работающая в интересах инновационности в процессе перехода к деятельности на базе цифровых технологий с учетом необходимых условий для обеспечения его функционирования. Полученные результаты исследования успешно использованы на практике и рекомендуются к дальнейшему распространению и внедрению в деятельность научно-производственных организаций.