Арктическая зона Российской Федерации (АЗРФ) представляет собой уникальный объект в системе управления народным хозяйством, которому отводится важнейшая роль в освоении природных ресурсов и реализации широкомасштабного проекта создания северного транспортного коридора. Реализация таких серьезных задач требует модернизации системы управления арктическими регионами, которая формировалась в соответствии с традиционными принципами вертикальной иерархии и не вполне способна к интеграции в рамках современной стратегии социально-экономического развития. Приоритетное внимание к регионам и территориям Арктической зоны (АЗ) предполагает отличительное государственное регулирование для развития потенциала северных российских территорий. Учитывая специфику АЗРФ, для результативного и эффективного использования ресурсов целесообразно развивать территории на основе экономической интеграции, в том числе с учетом кластерного подхода, что позволит координировать деятельность разнородных регионов в рамках одного конструктивного вектора развития. Внедрение системы менеджмента качества (СМК) в региональное управление обеспечит рост социально-экономических показателей и конкурентоспособности, а также содействует созданию новых форм сотрудничества между органами власти всех уровней, бизнес-структурами и населением. Так актуальной научной проблемой является совершенствование механизма взаимодействия регионов Российской Арктики, который учитывает специфику и дифференциацию регионов, сложившийся уровень взаимодействия, потенциал кластеризации, необходимость повышения результативности системы управления на региональном и местном уровне, а также стратегические ориентиры социально-экономического развития АЗРФ.