Детальная информация

Название: Создание инструмента оценки качества геномного материала на платформе для работы с Big Data: магистерская диссертация: 09.04.01
Авторы: Янушевский Александр Андреевич
Научный руководитель: Дробинцев Павел Дмитриевич
Организация: Санкт-Петербургский политехнический университет Петра Великого. Институт компьютерных наук и технологий
Выходные сведения: Санкт-Петербург, 2016
Коллекция: Выпускные квалификационные работы; Общая коллекция
Тематика: Вычислительные машины электронные — Применение в биологии и медицине; биоинформатика; геномика; оценка качества; bioinformatics; genomics; quality control
УДК: 004.9:57(043.3)
Тип документа: Выпускная квалификационная работа магистра
Тип файла: PDF
Язык: Русский
Уровень высшего образования: Магистратура
Код специальности ФГОС: 09.04.01
Группа специальностей ФГОС: 090000 - Информатика и вычислительная техника
DOI: 10.18720/SPBPU/2/v16-2303
Права доступа: Доступ по паролю из сети Интернет (чтение, печать, копирование)
Ключ записи: RU\SPSTU\edoc\35132

Разрешенные действия:

Действие 'Прочитать' будет доступно, если вы выполните вход в систему или будете работать с сайтом на компьютере в другой сети Действие 'Загрузить' будет доступно, если вы выполните вход в систему или будете работать с сайтом на компьютере в другой сети

Группа: Анонимные пользователи

Сеть: Интернет

Аннотация

Диссертация состоит из 5 разделов и посвящена разработке инструмента оценки качества геномного материала на платформе для работы с Big Data. В работе дано общее описание процесса секвенирования геномных данных. Проведен обзор существующих инструментов оценки качества секвенированных данных и обзор платформ для работы с Big Data. Поставлена задача реализации алгоритмов инструмента оценки качества FastQC на платформе Apache Spark для работы с Big Data. Для решения поставленной задачи описана архитектура приложения. По архитектуре реализовано приложение, выполняющее поставленную задачу. Приведены результаты замеров производительности разработанного приложения.

The dissertation consists of five sections and dedicated to creating a tool for genomic material quality control on the platform for work with Big Data. This paper gives a general description of sequencing process of genome material. Perform review of existing tools for genome material quality control and review of platforms for work with Big Data. Posed task of realization algorithms from quality control tool FastQC on platform Apache Spark for work with Big Data. For solving problem described architecture of program. Based on described architecture created application for solve problem. Report the results of the performance measurements of the developed application.

Права на использование объекта хранения

Место доступа Группа пользователей Действие
Локальная сеть ИБК СПбПУ Все Прочитать Печать Загрузить
Интернет Авторизованные пользователи СПбПУ Прочитать Печать Загрузить
-> Интернет Анонимные пользователи

Статистика использования

stat Количество обращений: 839
За последние 30 дней: 0
Подробная статистика