Details

Title: Моделирование динамики распространения транспозонов в геноме человека в норме и патологии: магистерская диссертация: 01.04.02
Creators: Черткова Александра Александровна
Scientific adviser: Гурский Виталий Валериевич
Organization: Санкт-Петербургский политехнический университет Петра Великого. Институт прикладной математики и механики
Imprint: Санкт-Петербург, 2017
Collection: Выпускные квалификационные работы; Общая коллекция
Subjects: Математическое моделирование; Биоэнергетика; транспозоны; мобильные элементы
UDC: 575.113/.118(043.3); 519.876.5(043.3)
Document type: Master graduation qualification work
File type: PDF
Language: Russian
Level of education: Master
Speciality code (FGOS): 01.04.02
Speciality group (FGOS): 010000 - Математика и механика
DOI: 10.18720/SPBPU/2/v17-3311
Rights: Доступ по паролю из сети Интернет (чтение, печать, копирование)
Record key: RU\SPSTU\edoc\44634

Allowed Actions:

Action 'Read' will be available if you login or access site from another network Action 'Download' will be available if you login or access site from another network

Group: Anonymous

Network: Internet

Annotation

Построена математическая модель динамики распространения транспозонов человека двух типов (L1 LINE и SINE элементы) в клетке на основе кинетических уравнений, реализующая конкуренцию за клеточные ресурсы. Большая часть параметров в модели оценена из экспериментальных данных. С помощью настройки значений свободных параметров найдено устойчивое стационарное решение, отвечающее состоянию клетки в нормальных условиях. Исследовано поведение модели в патологии: показано падение энергетических ресурсов при увеличении исходного числа копий активных транспозонов. При этом профиль энергии выходит на насыщение за счет ограниченных биологических ресурсов. Выявлено количество активных копий, при наличии которых в геноме клетка в течение длительного времени претерпевает значительный энергетический стресс. Показано, что при относительно небольшом снижении энергетического снабжения клетки наличие в модели активных транспозонов приводит к падению энергетических ресурсов на несколько порядков.

Document access rights

Network User group Action
ILC SPbPU Local Network All Read Print Download
Internet Authorized users SPbPU Read Print Download
-> Internet Anonymous

Table of Contents

  • Введение
  • Модель динамики распространения транспозонов
    • Постановка задачи
    • Обзор модели
    • Вывод скоростей реакций
      • Основные предположения
      • Транскрипция
      • Трансляция
      • Интеграция
      • Механизмы защиты
      • Репликация
  • Численное решение модели и настройка параметров
    • Настройка параметров
    • Устойчивость стационарного решения
  • Поведение модели в патологии
    • Увеличение числа транспозонов
    • Сокращение энергетического снабжения
  • Охрана труда
    • Повышенное зрительное напряжение
    • Костно-мышечные напряжения
    • Уровень шума
    • Требования к микроклимату помещения
    • Требования пожарной безопасности
    • Электробезопасность
    • Электромагнитные поля и последствия их воздействия
  • Список литературы

Usage statistics

stat Access count: 123
Last 30 days: 0
Detailed usage statistics