Детальная информация

Название: Моделирование регуляторной сети gap генов: магистерская диссертация: 03.04.02
Авторы: Наджафи Мождаба Ошнари
Научный руководитель: Гурский Виталий Валериевич
Организация: Санкт-Петербургский политехнический университет Петра Великого. Институт физики, нанотехнологий и телекоммуникаций
Выходные сведения: Санкт-Петербург, 2017
Коллекция: Выпускные квалификационные работы; Общая коллекция
Тематика: Математическое моделирование; модель экспрессии генов; регуляторные генные сети; дрозофила; эволюция; гены gap
УДК: 576.895.77:595.773.4(043.3); 519.876.5(043.3)
Тип документа: Выпускная квалификационная работа магистра
Тип файла: PDF
Язык: Русский
Уровень высшего образования: Магистратура
Код специальности ФГОС: 03.04.02
Группа специальностей ФГОС: 030000 - Физика и астрономия
DOI: 10.18720/SPBPU/2/v17-4203
Права доступа: Доступ по паролю из сети Интернет (чтение, печать, копирование)
Ключ записи: RU\SPSTU\edoc\45789

Разрешенные действия:

Действие 'Прочитать' будет доступно, если вы выполните вход в систему или будете работать с сайтом на компьютере в другой сети Действие 'Загрузить' будет доступно, если вы выполните вход в систему или будете работать с сайтом на компьютере в другой сети

Группа: Анонимные пользователи

Сеть: Интернет

Аннотация

Работа посвящена математическому моделированию эволюцию сети генов gap, которые представляют собой класс генов, контролирующих раннее развитие Drosophila melanogaster. Алгоритм моделирования включал в себя генерацию мутаций в регуляторной последовательности ДНК четырех генов gap, генетическую рекомбинацию и отбор индивидуумов, имеющих устойчивые паттерны экспрессии генов. Экспрессия генов gap для каждого индивида в каждом поколении вычислялась с помощью количественной модели (отображение генотипа в фенотип), которая была построена на основе экспериментальных данных по мРНК и белкам генов gap. Моделировалась эволюция популяции из 100 индивидов на более чем 5000 поколений, в условиях высокой скорости мутаций. Была проанализирована эволюционная динамика влияния на экспрессию (так называемые «регуляторные эффекты») от каждого участка ДНК, который связывает молекулы белков-регуляторов (сайты связывания). Была проведена классификация таких сайтов в соответствии с различными типами динамики их регуляторных эффектов и показано, что в ходе эволюции в регуляторной последовательности ДНК остается меньше сайтов, которые в совокупности становятся сильнее (в терминах регуляторных эффектов). Была вычислена корреляционная матрица, представляющая временные корреляции между регуляторными эффектами различных сайтов связывания. В корреляционной матрице превалируют положительные корреляции, что указывает на преобладание регуляторных компенсаций между сайтами белков-активаторов и сайтами белков-репрессоров. В целом, полученные результаты проливают свет на механизмы возможных перестроений ДНК в ходе эволюции и влияние этих перестроений на регуляцию развития дрозофилы.

Права на использование объекта хранения

Место доступа Группа пользователей Действие
Локальная сеть ИБК СПбПУ Все Прочитать Печать Загрузить
Внешние организации №2 Все Прочитать
Внешние организации №1 Все
Интернет Авторизованные пользователи СПбПУ Прочитать Печать Загрузить
Интернет Авторизованные пользователи (не СПбПУ, №2) Прочитать
Интернет Авторизованные пользователи (не СПбПУ, №1)
-> Интернет Анонимные пользователи

Статистика использования

stat Количество обращений: 147
За последние 30 дней: 0
Подробная статистика