Details

Title: Анализ данных, полученных в результате секвенирования генома человека: бакалаврская работа: 01.03.02
Creators: Кузнецов Павел Сергеевич
Scientific adviser: Иванков Алексей Александрович
Organization: Санкт-Петербургский политехнический университет Петра Великого. Институт прикладной математики и механики
Imprint: Санкт-Петербург, 2017
Collection: Выпускные квалификационные работы; Общая коллекция
Subjects: секвенирование; сигнал покрытия прочтениями; энтропия; вейвлет-преобразование
Document type: Bachelor graduation qualification work
File type: PDF
Language: Russian
Level of education: Bachelor
Speciality code (FGOS): 01.03.02
Speciality group (FGOS): 010000 - Математика и механика
DOI: 10.18720/SPBPU/2/v17-6585
Rights: Доступ по паролю из сети Интернет (чтение, печать, копирование)
Record key: RU\SPSTU\edoc\48824

Allowed Actions:

Action 'Read' will be available if you login or access site from another network Action 'Download' will be available if you login or access site from another network

Group: Anonymous

Network: Internet

Annotation

Настоящая работа посвящена анализу данных, полученных в результате секвенирования генома человека. Актуальность работы заключается в том, что имея только сигнал покрытия прочтениями можно будет сделать вывод о наличии и локализации аберраций генома. Исследована возможность использования энтропии как инвариантной оценки (относительно референсного генома) сигнала покрытия прочтениями. С помощью разработанного программного обеспечения были получены: оценки математического ожидания и дисперсии для сигнала покрытия прочтениями, оценки энтропии для исходного сигнала покрытия прочтениями, оценки спектральной плотности исходного сигнала и сигнала, полученного в результате вейвлет-преобразования исходных данных. Идентифицированы выбросы за уровень двух (трех) среднеквадратических отклонений для каждой из вышеперечисленных оценок. Они являются исходными данными для последующего анализа специалистами-генетиками результатов секвенирования на предмет наличия мутаций в этих геномах.

Document access rights

Network User group Action
ILC SPbPU Local Network All Read Print Download
Internet Authorized users SPbPU Read Print Download
-> Internet Anonymous

Usage statistics

stat Access count: 149
Last 30 days: 0
Detailed usage statistics