С 17 марта 2020 г. для ресурсов (учебные, научные, материалы конференций, статьи из периодических изданий, авторефераты диссертаций, диссертации) ЭБ СПбПУ, обеспечивающих образовательный процесс, установлен особый режим использования. Обращаем внимание, что ВКР/НД не относятся к этой категории.

Детальная информация

Название: Повышение эффективности сортировки генетических последовательностей в проекте SAMtools на архитектурах MIMD: выпускная квалификационная работа бакалавра: 09.03.04 - Программная инженерия ; 09.03.04_01 - Технологии разработки и сопровождения качественного программного продукта
Авторы: Журавлёва Александра Юрьевна
Научный руководитель: Федоров Станислав Алексеевич
Организация: Санкт-Петербургский политехнический университет Петра Великого. Институт компьютерных наук и технологий
Выходные сведения: Санкт-Петербург, 2018
Коллекция: Выпускные квалификационные работы; Общая коллекция
Тематика: SAMTOOLS; INTEL AMPLIFIER; сортировка слиянием; сеть сорртировки; автовекторизация
Тип документа: Выпускная квалификационная работа бакалавра
Тип файла: PDF
Язык: Русский
Код специальности ФГОС: 09.03.04
Группа специальностей ФГОС: 090000 - Информатика и вычислительная техника
Ссылки: Отзыв руководителя
DOI: 10.18720/SPBPU/2/v18-1338
Права доступа: Свободный доступ из сети Интернет (чтение, печать, копирование)

Разрешенные действия:

Действие 'Прочитать' будет доступно, если вы выполните вход в систему или будете работать с сайтом на компьютере в другой сети Действие 'Загрузить' будет доступно, если вы выполните вход в систему или будете работать с сайтом на компьютере в другой сети

Группа: Анонимные пользователи

Сеть: Интернет

Аннотация

В представленной работе рассматривается усовершенствование утилиты сортировки генетической информации в проекте с открытым исходным кодом SAMtools. Проведено исследование новых алгоритмов, подходов векторизации и параллелизации с целью выбора наилучшей модификации для внедрения в код официального репозитория. В результате были разработаны алгоритмы поразрядной сортировки и сети сортировки, производительность которых лучше исходного варианта по разным оценкам от 3 до 9 раз. Обозначены перспективы векторизации разработанных методов. Реализация поразрядной сортировки была принята в исходный код официального репозитория SAMtools и успешно применяется при работе с генетическими данными в области медицины и биоинформатики.

Права на использование объекта хранения

Место доступа Группа пользователей Действие
Локальная сеть ИБК СПбПУ Все Прочитать Печать Загрузить
Интернет Авторизованные пользователи Прочитать Печать Загрузить
-> Интернет Анонимные пользователи

Статистика использования документа

stat Количество обращений: 240
За последние 30 дней: 1
Подробная статистика