Детальная информация
Название | Разработка и оптимизация методов ОТ-ПЦР анализа микроРНК: выпускная квалификационная работа бакалавра: 16.03.01 - Техническая физика ; 16.03.01_06 - Медицинская и биоинженерная физика |
---|---|
Авторы | Коробкина Екатерина Александровна |
Научный руководитель | Богомаз Денис Игоревич |
Другие авторы | Октябрьский Валерий Павлович |
Организация | Санкт-Петербургский политехнический университет Петра Великого. Институт биомедицинских систем и биотехнологий |
Выходные сведения | Санкт-Петербург, 2019 |
Коллекция | Выпускные квалификационные работы ; Общая коллекция |
Тематика | микроРНК ; ОТ-ПЦР ; биомаркеры ; сравнительный анализ ; праймеры ; microRNA ; RT-qPCR ; biomarkers ; comparative analysis ; primers |
Тип документа | Выпускная квалификационная работа бакалавра |
Тип файла | |
Язык | Русский |
Уровень высшего образования | Бакалавриат |
Код специальности ФГОС | 16.03.01 |
Группа специальностей ФГОС | 160000 - Физико-технические науки и технологии |
Ссылки | Отзыв руководителя ; Отчет о проверке на объем и корректность внешних заимствований |
DOI | 10.18720/SPBPU/3/2019/vr/vr19-1427 |
Права доступа | Доступ по паролю из сети Интернет (чтение, печать, копирование) |
Ключ записи | ru\spstu\vkr\2721 |
Дата создания записи | 04.10.2019 |
Разрешенные действия
–
Действие 'Прочитать' будет доступно, если вы выполните вход в систему или будете работать с сайтом на компьютере в другой сети
Действие 'Загрузить' будет доступно, если вы выполните вход в систему или будете работать с сайтом на компьютере в другой сети
Группа | Анонимные пользователи |
---|---|
Сеть | Интернет |
МикроРНК – класс малых молекул – перспективных биомаркеров, ре-гулирующих экспрессию генов на посттранскрипционном уровне. Многие патологические процессы сопровождаются изменением профиля микроРНК в клетках. В данной работе описаны методы выделения микроРНК из различ-ных биологических образцов. Приведены описания основных методов ОТ-ПЦР анализа, применимых для микроРНК. Эти методы ОТ-ПЦР анализа бы-ли применены на практике, для каждого была определена оптимальная об-ласть применения. Разработан и оптимизирован наиболее приемлемый метод анализа микроРНК в клинических образцах.
MicroRNA is a class of small molecules - promising biomarkers which regu-late gene expression at the posttranscriptional level. Many pathological processes are accompanied by a change in the profile of miRNA in cells. In the given work methods of isolating miRNA from various biological samples are described. The descriptions of the main methods of RT-qPCR analysis applicable for miRNA are given. These methods of RT-qPCR analysis were applied in practice, the scope for each method was specified. The most acceptable method of miRNA analysis in clinical samples was developed and optimized.
Место доступа | Группа пользователей | Действие |
---|---|---|
Локальная сеть ИБК СПбПУ | Все |
|
Интернет | Авторизованные пользователи СПбПУ |
|
Интернет | Анонимные пользователи |
|
- диплом файнал
- РЕФЕРАТ
- РЕФЕРАТ
- THE ABSTRACT
- диплом файнал
- Список использованных сокращений
- ВВЕДЕНИЕ
- 1.2. Жидкофазные методы
- 1.2.1. Специфичное выделение
- 1.2.2. Одновременное выделение РНК и ДНК
- 1.3. Твердофазные методы
- 1.3.1. Магнитная сепарация
- 1.3.2. Выделение с помощью спин-колонок
- ГЛАВА 2. ОТ-ПЦР МЕТОДЫ АНАЛИЗА МИКРОРНК
- 2.1 Основные сведения о ПЦР
- 2.1.1 Этапы ПЦР
- 2.1.2. Способы оценки эффективности ПЦР
- 2.2. Варианты «универсалъной» ОТ, применимые для миркоРНК
- 2.2.1. Полиаденилирование (синтез поли-А хвоста)
- 2.2.2. Универсальная элонгация и последующий ОТ-ПЦР анализ
- 2.3. Варианты «специфичной» ОТ, применимые для миркоРНК
- 2.3.1. Stem-loop метод ОТ-ПЦР анализа
- 2.3.2. Two-tail метод ОТ-ПЦР
- ГЛАВА 3. ПРОВЕДЕНИЕ ЭКСПЕРИМЕНТОВ С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ РАЗЛИЧНЫХ МЕТОДОВ ОТ-ПЦР АНАЛИЗА. РЕЗУЛЬТАТЫ ИССЛЕДОВАНИЯ
- 3.1. Методы выделения
- 3.1.1. Выделение тотальной РНК из культур клеток
- 3.1.2. Выделение РНК из тонкоигольной аспирационной биопсии (ТАБ)
- 3.1.3. Выделение РНК из гистологических срезов
- 3.2. Результаты
- 3.2.1. Динамический диапазон регистрации синтетической микроРНК-451
- 3.2.2. Анализ экспрессии различных микроРНК в клеточных линиях
- 3.2.3. Анализ экспрессии различных микроРНК в клинических образцах
- ГЛАВА 4. ПРИМЕНЕНИЕ МЕТОДА TWO-TAIL В КЛИНИЧЕСКИХ ИССЛЕДОВАНИЯХ 4.1. Выбор потенциально маркерных микроРНК путем широкого скрининга (cancer-related miRNA panel)
- 4.2. Применение метода two-tail для диагностики клинических образцов
- ЗАКЛЮЧЕНИЕ
- Список использованных источников
- Приложение 1. Последовательности олигонуклеотидов
- Приложение 2. Значения Сt анализа образцов аденокарциномы и список детектируемых микроРНК
- Приложение 3. Значения Сt анализа образцов очаговых псевдотуморозных образований и список детектируемых микроРНК
Количество обращений: 75
За последние 30 дней: 0