Детальная информация

Название: Разработка алгоритма иерархической бикластеризации данных генной экспрессии: выпускная квалификационная работа магистра: 02.04.03 - Математическое обеспечение и администрирование информационных систем ; 02.04.03_01 - Математическое обеспечение и администрирование корпоративных информационных систем
Авторы: Клеверов Максим Анатольевич
Научный руководитель: Щукин Александр Валентинович
Другие авторы: Колосова Ольга Владимировна
Организация: Санкт-Петербургский политехнический университет Петра Великого. Институт компьютерных наук и технологий
Выходные сведения: Санкт-Петербург, 2019
Коллекция: Выпускные квалификационные работы; Общая коллекция
Тематика: Алгоритмы; Молекулярная биология; наука о данных; бикластеризация; семантическая близость; генная онтология; экспрессия генов; статистика
УДК: 004.421; 577.2
Тип документа: Выпускная квалификационная работа магистра
Тип файла: PDF
Язык: Русский
Код специальности ФГОС: 02.04.03
Группа специальностей ФГОС: 020000 - Компьютерные и информационные науки
Ссылки: Отзыв руководителя; Рецензия; Отчет о проверке на объем и корректность внешних заимствований
DOI: 10.18720/SPBPU/3/2019/vr/vr19-923
Права доступа: Доступ по паролю из сети Интернет (чтение, печать, копирование)

Разрешенные действия:

Действие 'Прочитать' будет доступно, если вы выполните вход в систему или будете работать с сайтом на компьютере в другой сети Действие 'Загрузить' будет доступно, если вы выполните вход в систему или будете работать с сайтом на компьютере в другой сети

Группа: Анонимные пользователи

Сеть: Интернет

Аннотация

В данной работе разработан новый алгоритм иерархической бикластеризации данных генной экспрессии на основе функциональной близости генов. Близость генов вычисляется на основе предложенной меры семантической близости узлов в Генной Онтологии. Кроме того, исследованы методы анализа биологической обоснованности бикластеров и статистическими методами показано значительное улучшение качества разбиения тестового набора данных в сравнении с другими популярными алгоритмами.

In this work a novel hierarchical biclustering algorithm of gene expression data based on gene functional similarity is introduced. Gene similarity is calculated in accordance with new proposed semantic similarity measure of Gene Ontology terms. In addition, we researched biological validation procedures and demonstrate significant improvement in the quality of dataset division in comparing with other popular algorithms.

Права на использование объекта хранения

Место доступа Группа пользователей Действие
Локальная сеть ИБК СПбПУ Все Прочитать Печать Загрузить
Интернет Авторизованные пользователи Прочитать Печать Загрузить
-> Интернет Анонимные пользователи

Статистика использования

stat Количество обращений: 25
За последние 30 дней: 0
Подробная статистика