Details

Title: Алгоритмическая компенсация нестабильности положения электродной матрицы при многоканальных экстраклеточных отведениях: выпускная квалификационная работа бакалавра: направление 16.03.01 «Техническая физика» ; образовательная программа 16.03.01_06 «Медицинская и биоинженерная физика»
Creators: Ешимов Артур
Scientific adviser: Власова Ольга Леонардовна
Other creators: Октябрьский Валерий Павлович
Organization: Санкт-Петербургский политехнический университет Петра Великого. Институт биомедицинских систем и биотехнологий
Imprint: Санкт-Петербург, 2020
Collection: Выпускные квалификационные работы; Общая коллекция
Subjects: сортировка спайков; экстраклеточные отведения; моделирование внеклеточных потенциалов; смещение электродов; мульти-электродная матрица; spike sorting; extracellular recordings; modeling; electrode drift; multielectrode array
Document type: Bachelor graduation qualification work
File type: PDF
Language: Russian
Level of education: Bachelor
Speciality code (FGOS): 16.03.01
Speciality group (FGOS): 160000 - Физико-технические науки и технологии
Links: Отзыв руководителя; Отчет о проверке на объем и корректность внешних заимствований
DOI: 10.18720/SPBPU/3/2020/vr/vr20-3404
Rights: Доступ по паролю из сети Интернет (чтение)
Record key: ru\spstu\vkr\9240

Allowed Actions:

Action 'Read' will be available if you login or access site from another network

Group: Anonymous

Network: Internet

Annotation

Данная работа посвящена изучению алгоритмических методов сортировки спайков, освещению текущих проблем в этой области, описанию методологии моделирования и решения проблемы смещения электродных матриц при многоканальной регистрации внеклеточных потенциалов. В работе детально описаны основные этапы алгоритмической сортировки спайков, такие как предобработка сигнала, автоматическое детектирование электрической активности нейронов и дифференцировка потенциалов действия разных нейронов (кластеризация). Приведены методы моделирования нейронов на основе реалистичных биофизических моделей для проверки работоспособности алгоритмов сортировки и состоятельности получаемых результатов, в том числе методы моделирования смещений записывающих электродов. Описан новейший метод корректировки нестабильности записывающей мульти-электродной матрицы, потенциально позволяющий повысить качество сортировки спайков, что является одним из главных условий прогресса в изучении нейронных процессов.

This work is devoted to the study of algorithmic methods for spike sorting, current problems in this area, description of the current modeling methods and the problem of drifts of electrode arrays during multichannel recordings of extracellular potentials. The paper describes in detail the main stages of spike sorting such as signal preprocessing, automated detection of the spiking activity and differentiation of the action potentials of different neurons (clustering). The work also describes the neuron modelling methods based on realistic biophysical models to test the performance of sorting algorithms and the consistency of the results. Electrode drifts modelling is presented as well. The method for detection and correction the instability of a recording multielectrode array is described, which potentially can improve the quality of spike sorting. And that in turn is one of the main conditions for progress in the study of neural processes.

Document access rights

Network User group Action
ILC SPbPU Local Network All Read
Internet Authorized users SPbPU Read
-> Internet Anonymous

Usage statistics

stat Access count: 6
Last 30 days: 0
Detailed usage statistics