Детальная информация

Транскрипция — процесс синтеза РНК по матрице ДНК, первый шаг, необходимый для реализации экспрессии генов. Для изучения динамики данного процесса используются различные методы, включая одномолекулярные, одним из которых является метод акустической силовой спектроскопии (АСС). Данная работа посвящена изучению влияния антибиотика стрептолидигина на процесс элонгации транскрипции с использованием этого метода. В результате проведенных исследований показано, что мгновенная скорость транскрипции не зависит от наличия стрептолидигина, в то время как среднее значение скорости заметно уменьшается из-за возникающих в его присутствии единичных продолжительных пауз.

Acoustic force spectroscopy is a novel technique which allows to apply force and manipulate by microscopic biological objects. Recently this method was employed for studying transcription elongation at the single-molecule level. Streptolydigin is an antibiotic that targets bacterial transcription by blocking folding of the trigger loop in the active center of RNA polymerase. Here the acoustic force spectroscopy technique is used to characterize the transcription elongation dynamics and RNAP inhibition by streptolydigin at the single-molecule level.