Детальная информация

Данная работа посвящена исследованию основных и редких транслокаций с участием гена RET и оптимизации тестирования образцов опухолей легкого для их обнаружения. В качестве метода исследования выбрана обратно-транскрипционная полимеразная цепная реакция (ОТ-ПЦР) по причине доступности, возможности использования образцов нуклеиновых кислот из парафиновых блоков, не требующих специальных условий хранения, и при этом высокой чувствительности. Методика проведения анализа включает как оценку на несбалансированную экспрессию гена RET, так и детекцию конкретного варианта транслокации с помощью отдельного, специфического, ПЦР-исследования.В ходе работы было проанализировано 7475 образцов, и перестройка была обнаружена в 131 из них (встречаемость мутации составила 1,1%). Всего было выявлено 9 вариантов мутации, из них 3 относятся к редким. Тест на оценку несбалансированности экспрессии соотносится с наличием химерного транскрипта в 93,8% случаев. По результатам статистической обработки, определена ассоциация с женским полом и не выявлено ассоциации с возрастом. Данный анализ актуален и клинически востребован в силу использования в онкологической практике таргетных препаратов (ингибиторов тирозинкиназ), нацелено воздействующих на подавление опухолей при транслокации рецепторных тирозинкиназ.

The given work is devoted to the study of major and rare RET-translocations and optimization of testing lung tumor samples for their detection. Reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR) was chosen as a method of analysis because of its availability, the possibility to use nucleic acid samples from paraffin blocks that do not require special storage conditions, and high sensitivity. The assay methodology includes both assessment for unbalanced expression of RET gene and detection of a specific translocation variant using a separate, specific, PCR assay.In the work, 7475 samples were analyzed, and the rearrangement was detected in 131 of them (mutation incidence was 1.1%). A total of 9 mutation variants were identified, of which 3 were rare. The unbalanced expression test correlated with the presence of a chimeric transcript in 93.8% of cases. According to the results of statistical processing, an association with female gender was determined and no association with age was detected. This analysis is relevant and clinically demanded due to the use of selective medicines (tyrosine kinase inhibitors) targeting tumor suppression of receptor tyrosine kinase translocation in oncology practice.