Детальная информация

Название: Автоматизация трекинга объектов в временных сериях биологических изображений: выпускная квалификационная работа бакалавра: направление 01.03.02 «Прикладная математика и информатика» ; образовательная программа 01.03.02_04 «Биоинформатика»
Авторы: Чибышев Тимофей Андреевич
Научный руководитель: Козлов Константин Николаевич
Организация: Санкт-Петербургский политехнический университет Петра Великого. Физико-механический институт
Выходные сведения: Санкт-Петербург, 2024
Коллекция: Выпускные квалификационные работы; Общая коллекция
Тематика: обработка изображений; автоматизация; трекинг; регистрация изображений; язык программирования Python; image processing; automation; tracking; image registration; Python programming language
Тип документа: Выпускная квалификационная работа бакалавра
Тип файла: PDF
Язык: Русский
Уровень высшего образования: Бакалавриат
Код специальности ФГОС: 01.03.02
Группа специальностей ФГОС: 010000 - Математика и механика
DOI: 10.18720/SPBPU/3/2024/vr/vr24-5336
Права доступа: Доступ по паролю из сети Интернет (чтение)
Дополнительно: Новинка
Ключ записи: ru\spstu\vkr\30027

Разрешенные действия:

Действие 'Прочитать' будет доступно, если вы выполните вход в систему или будете работать с сайтом на компьютере в другой сети

Группа: Анонимные пользователи

Сеть: Интернет

Аннотация

В данной работе разработан программный пакет на языке Python, который позволяет производить трекинг колоний клеток на основе заданного набора биоинформатических изображений. Пакет также поддерживает параллельную работу скрипта, что позволяет более эффективно использовать вычислительные ресурсы. В результате процесс обработки биоинформатических изображений существенно улучшился: он стал более эффективным, воспроизводимым и понятным для исследователей и специалистов в области биологии и медицины. Проведено тестирование и оценка разработанных методов и инструментов на подготовленном наборе данных, включающем изображения колоний плюрипотентных клеток человека на питательной среде в ходе прижизненой съемки экспериментальных препаратов. Это помогло улучшить отслеживание колоний клеток и повысить точность анализа.

In this work, a software package developed in Python is presented, which allows tracking of cell colonies based on a given set of bioinformatics images. The package also supports parallel execution of the script, enabling more efficient use of computational resources. As a result, the process of bioinformatics image processing has significantly improved, becoming more efficient, reproducible, and comprehensible for researchers and specialists in the fields of biology and medicine. The developed methods and tools were tested and evaluated on a prepared dataset including images of human pluripotent cell colonies on nutrient medium during lifetime imaging of experimental preparations. This helped to improve the tracking of cell colonies and increase the accuracy of the analysis.

Права на использование объекта хранения

Место доступа Группа пользователей Действие
Локальная сеть ИБК СПбПУ Все Прочитать
Интернет Авторизованные пользователи СПбПУ Прочитать
-> Интернет Анонимные пользователи

Оглавление

  • Тема выпускной квалификационной работы
    • Введение
    • 1. ФОРМАЛИЗАЦИЯ ЗАДАЧИ
    • 2. БАЗОВЫЕ АЛГОРИТМЫ РАБОТЫ С ИЗОБРАЖЕНИЯМИ
    • 3. РАЗРАБОТКА МЕТОДОВ
    • 4. Эксперименты и сравнительный анализ
    • Выводы
    • Заключение
    • Словарь терминов
    • Список использованных источников

Статистика использования

stat Количество обращений: 0
За последние 30 дней: 0
Подробная статистика