Детальная информация
Название | Разработка модели машинного обучения для прогнозирования фенотипа нута с учетом параметров развития: выпускная квалификационная работа бакалавра: направление 01.03.02 «Прикладная математика и информатика» ; образовательная программа 01.03.02_04 «Биоинформатика» |
---|---|
Авторы | Ироносов Артемий Вячеславович |
Научный руководитель | Козлов Константин Николаевич |
Организация | Санкт-Петербургский политехнический университет Петра Великого. Физико-механический институт |
Выходные сведения | Санкт-Петербург, 2025 |
Коллекция | Выпускные квалификационные работы ; Общая коллекция |
Тематика | APSIM Next Generation ; машинное обучение ; нут ; ОНП ; фенотип ; XGBoost ; LightGBM ; Random Forest ; Catboost ; linear regression ; machine learning ; chickpea ; SNP ; phenotype |
Тип документа | Выпускная квалификационная работа бакалавра |
Тип файла | |
Язык | Русский |
Уровень высшего образования | Бакалавриат |
Код специальности ФГОС | 01.03.02 |
Группа специальностей ФГОС | 010000 - Математика и механика |
DOI | 10.18720/SPBPU/3/2025/vr/vr25-2690 |
Права доступа | Доступ по паролю из сети Интернет (чтение, печать, копирование) |
Дополнительно | Новинка |
Ключ записи | ru\spstu\vkr\36984 |
Дата создания записи | 28.08.2025 |
Разрешенные действия
–
Действие 'Прочитать' будет доступно, если вы выполните вход в систему или будете работать с сайтом на компьютере в другой сети
Действие 'Загрузить' будет доступно, если вы выполните вход в систему или будете работать с сайтом на компьютере в другой сети
Группа | Анонимные пользователи |
---|---|
Сеть | Интернет |
В данной работе разработан гибридный метод прогнозирования урожайности нута, объединяющий генетические данные (ОНП-маркеры) с фенологическими параметрами, полученными в результате калибровки модели APSIM и экспериментальными данными за 2016, 2017 и 2022 годы. Для построения регрессионных моделей использованы современные алгоритмы машинного обучения, качество которых оценивалось с помощью метрик RMSE, R^2. Полученные модели продемонстрировали высокую предсказательную способность, позволяющую объяснить до 76 % дисперсии фенотипических показателей урожайности нута, что свидетельствует о значительном влиянии генотипической информации на результат. Результаты исследования открывают перспективы применения предложенного подхода в задачах геномного отбора и селекции сельскохозяйственных культур, способствуя оптимизации программ селекции, повышению устойчивости культур к изменению климатических условий и улучшению продовольственной безопасности.
In this study, a hybrid method for predicting chickpea yield was developed by integrating genetic data (SNP markers) with physiological parameters obtained from the calibration of the APSIM model and experimental data from the years 2016, 2017, and 2022. Modern machine learning algorithms were employed to build regression models, whose quality was evaluated using RMSE, R^2 metrics. The resulting models demonstrated high predictive power, explaining up to 76% of the variance in chickpea yield-related phenotypic traits, which attests to the significant impact of genotypic data on the outcome. The study’s findings open up promising prospects for using the proposed approach in genomic selection and crop breeding, contributing to the optimization of breeding programs, enhancing crop resilience to changing climatic conditions, and improving food security.
Место доступа | Группа пользователей | Действие |
---|---|---|
Локальная сеть ИБК СПбПУ | Все |
|
Интернет | Авторизованные пользователи СПбПУ |
|
Интернет | Анонимные пользователи |
|
Количество обращений: 0
За последние 30 дней: 0