Details

В данной работе проводилось комплексное исследование семейства генов nxf1 на эволюционно широком наборе организмов с целью оценки возможности использования семейства генов в качестве эволюционного маркёра. Особое внимание уделялось изучению различных структур, включая мРНК с сохранённым интроном, что позволило выявить новые особенности регуляции. Впервые обнаружен конститутивный транспортный элемент (CTE) у курицы. Разработан подход к предсказанию вторичной структуры элементов мРНК в отсутствие экспериментальных данных. В настоящем исследовании, используя методы предсказания вторичной структуры, мы выявили в CTE интронов человека, курицы и гидры структурные элементы, гомологичные ранее описанным в CTE вируса MPMV последовательности, отвечающее за связывания с белком TAP, в мРНК, подвергающейся альтернативному сплайсингу. Было установлено, что несмотря на относительно высокую скорость структурных изменений самого гена Nxf1, его ключевые функции остаются неизменными, что накладывает ограничения на использование этого семейства в качестве универсального маркёра, но подчёркивает его ценность в качестве индикатора недавних эволюционных событий.

This study conducted a comprehensive investigation of the Nxf1 genes across an evolutionarily broad range of organisms to assess its potential as an evolutionary marker. Special attention was given to analyzing various structural features, including mRNAs with conserved introns, which revealed novel regulatory mechanisms. A constitutive transport element (CTE) was identified in chicken for the first time. We developed a novel computational approach for predicting mRNA secondary structure elements in the absence of experimental data. Applying these secondary structure prediction methods, we identified structural motifs within the CTE regions of human, chicken, and hydra introns that are homologous to the TAP-binding sequences previously characterized in the MPMV retroviral CTE. Our findings demonstrate that despite a relatively high rate of structural divergence within the Nxf1 gene itself, its core functional domains remain conserved. This imposes limitations on its use as a universal phylogenetic marker while highlighting its significant value as an indicator of recent evolutionary events.

• титульник
  • Анализ генов семейства nxf1, контролирующих транспорт рнк
• Итог2
  • ZAD
    • Физико-механический институт
    • ЗАДАНИЕ
  • My_thesis
    • Введение
    • 1. Обзор литературы
    • 2. материалы и методы исследования
    • 3. Результаты исследования
    • Заключение
    • Список использованных источников