Задачи исследования: − определить и оценить спектр и структуру систем антифаговой защиты клетки в полногеномных последовательностях бактерий семейства Rhizobiaceae; − оценить наличие и структурный полиморфизм генов систем антифаговой защиты в клетках; − оценить различия между группами географически различных популяций природных штаммов Sinorhizobium spp; − провести филогенетический анализ нуклеотидных последовательностей гена, кодирующего один из элементов систем антифаговой защиты клетки. Объект исследования – клубеньковые бактерии семейства Rhizobiaceae. Работа выполнена на базе лаборатории генетики и селекции микроорганизмов ФГБНУ ВНИИСХМ. Работа посвящена изучению разнообразия генетических элементов в геномах бактерий семейства Rhizobiaceae, вовлеченных в антифаговую защиту клетки. В результате работы был выявлен широкий спектр новых систем антифаговой защиты клетки бактерий семейства Rhizobiaceae, был проведен филогенетический и ПЦР-ПДРФ анализ штаммов Sinorhizobium spp. При написании литературного обзора использовались следующие базы данных: NCBI, ScienceDirect, Scopus, eLIBRARY.RU, CyberLeninka. Статистическую обработку экспериментальных данных осуществляли с использованием пакета программ Microsoft Office и Past4.
Tasks that were solved in the course of the study: evaluation of the spectrum and structure of cell antiphage defence systems in full genome sequences of the Rhizobiaceae family bacteria; – analysis of the presence and structural polymorphism of genes of antiphage defense systems in cells; – analysis the differences between groups of geographically different populations of natural strains of Sinorhizobium spp.; – perform phylogenetic analysis of the nucleotide sequences of the gene encoding one of the elements of the cells antiphage defense systems. The object of research is root-nodule bacteria of the Rhizobiaceae family. The work was carried out on the basis of the Laboratory of Genetics and Selection of Microorganisms of the All-Russian Research Institute of Agricultural Microbiology. The work is devoted to studying the diversity of genetic elements in the genomes of bacteria of the Rhizobiaceae family, involved in cell antiphage protection. As a result of the work, a wide range of new systems of antiphage protection of Rhizobiaceae bacterial cells was identified, phylogenetic and PCR-RFLP analysis of Sinorhizobium spp. strains was performed. The following databases were used for writing the literature review: NCBI, ScienceDirect, Scopus, and eLIBRARY.RU, CyberLeninka. Statistical processing of experimental data was performed using the Microsoft Office software package and Past4.
