Детальная информация

Задачи, решаемые в ходе исследования: 1. освоение и адаптирование методов работы с ризобиофагами; 2. проведение выделения ризобиофагов из городских почв с использованием метода обогащения и получение чистых культур фагов с использованием метода двуслойного агара по Адамсу; 3. оценка биологических свойств полученных ризобиофагов (морфология негативных колоний, температурная устойчивость, оценка спектра литической активности, рестрикционный анализ фаговой ДНК); 4. освоение методов выделения штаммов клубеньковых бактерий; выделение штаммов из городских почв методом plant–trapping (из клубеньков, образованных на корнях растения–хозяина в условиях микровегетационных опытов) и проведение видовой идентификации штаммов клубеньковых бактерий методом анализа ПЦР–ПДРФ фрагмента гена 16S рДНК; 5. оценка фагово–микробных взаимодействий в условиях совместного культивирования в жидкой культуре и в условиях микровегетационного опыта. Объектами исследования являлись ризобиофаги и бактерии вида Sinorhizobium meliloti. Работа выполнена на базе лаборатории генетики и селекции микроорганизмов ФГБНУ ВНИИСХМ. В данной работе получено три новых ризобиофага и пятнадцать природных штаммов клубеньковых бактерий двух близкородственных видов Sinorhizobium meliloti и Sinorhizobium medicae из городской среды. Проведена  оценка биологических свойств культур ризобиофагов и оценена их активность в фагово-микробных взаимодействиях в различных условиях. Установлено, что ризобиофаги существенно различаются по специфичности взаимодействия как со штаммами ризобий одного вида, так и по отношению в близкородственным видам ризобий, и могут оказывать достоверное влияние на процесс клубенькообразования. При написании литературного обзора использовались следующие базы данных: eLIBRARY.RU, Pubmed, Scopus. Статистическую обработку экспериментальных данных осуществляли с использованием программ: Microsoft Excel, PAST.

The tasks carried out in the course of the study: 1. learn and practice the techniques of dealing with rhizobiophage; 2. isolation of rhizobiophages from soil samples using the enrichment protocol and obtaining pure phage cultures by the Adams double-layer agar method; 3. evaluation of biological properties of the obtained rhizobiophages (morphology of negative colonies, temperature stability, evaluation of phage lytic activity, restriction analysis of phage DNA); 4. learn and practice methods for isolation of nodule bacteria strains; isolation of strains from soil samples by plant-trapping method (from nodules formed on the roots of the host plant under conditions of microvegetation experiment) and conducting  species identification of nodule bacteria strains by PCR-RFLP analysis of 16S rDNA gene fragment; 5. evaluation of phage-microbial interactions under conditions of their co-cultivation in liquid medium and under conditions of microvegetation experiment with plants. The objects of research were rhizobiophages and bacteria of Sinorhizobium meliloti species. The work was carried out in the laboratory of genetics and selection of microorganisms of All-Russia Research Institute of Agricultural Microbiology. In this work three new rhizobiophages and fifteen native strains of rhizobia of the two closely related species Sinorhizobium meliloti и Sinorhizobium  medicae were obtained from urban ecosystem. The biological properties of the isolated bacteriophages and their activity in phage-microbe interactions under different conditions were evaluated. The study found that rhizobiophages differ significantly in the specificity of interaction with rhizobia strains of the same species as well as against rhizobia of closely related species and can have a reliable effect on the process of nodulation. When writing the literature review, the following databases were used: eLIBRARY.RU, Pubmed, Scopus. Statistical processing of the experimental data was carried out using the software: Microsoft Excel, PAST.