Структура хроматина влияет на фундаментальные клеточные процессы, такие как транскрипция и репликация в условиях высокой концентрации ДНК. Для осуществления своих функций клетке приходится модифицировать структуру хроматина, это говорит о связи упаковки ДНК с ее функциями. Для объяснения структуры хроматина предложена фрактальная модель организации ДНК на основе данных Hi-C, диффузии наночастиц в хроматине, нейтронного рассеяния. Эта работа направлена на дальнейшее изучение свойств хроматина, в частности его динамики. С помощью системы CRISPR/dCas9 мы флюоресцентно пометили ген p53 и теломеры в клетках HEK293. Анализируя подвижность меченного гена и теломер, мы сможем судить о корреляции в движении генов и их функций при прохождении клетки по клеточному циклу и о фрактальных свойствах упаковки хроматина.

Chromatin structure is tightly interconnected with such a fundamental cellular processes as DNA replication and transcription. In order to execute these vitally important functions, cells have to modify chromatin structure, which is an evidence of tight link between chromatin structure and DNA function. Recently, fractal model of the chromatin organization has been proposed based on Hi-C studies, studies of nanoparticles diffusion in chromatin and neutron scattering research. The present project is aiming to further explore chromatin structure focusing on chromatin dynamics in live cells. We have been used the CRISPR/dCas9 system to visualize gene p53 and telomers in HEK293 cells. The p53 tumor suppressor acts as a guardian of the genome in mammalian cells undergoing DNA double strand breaks induced by a various forms of cell stress, including inappropriate growth signals or ionizing radiation. We will analyze dynamics of these genes and its correlation with gene functions.

• Санкт-Петербургский политехнический университет Петра Великого
• Введение.
• Обзор литературы.
  • Упаковка хроматина.
  • Динамика хроматина.
  • Фрактальная модель.
  • Теоретические модели структуры хроматина.
  • CRISPR/dCas9.
• Материалы и методы.
• Результаты.
• Заключение.
• Список литературы: