Details

Магистерская диссертация посвящена разработке инструментария для проведения экспериментальных исследований в новом научном направлении - молекулярной медицине, в котором проблемы диагностики, профилактики и лечения решаются на молекулярном уровне при помощи анализа нуклеиновых кислот - ДНК, РНК и продуктов их экспрессии (белков). В настоящее время для проведения анализа специалистам по биоинформатике необходимо взаимодействовать с инфраструктурой, состоящей из высокопроизводительных вычислительных ресурсов, крупномасштабного хранилища и эфффективных инструментов. Как правило, анализы осуществляется несколькими программными инструментами, обрабатывающими последовательно входные данные. Этапы анализа обычно выполняются на сервере или кластере, пригодном для многоступенчатой обработки больших данных. Для эффективного проведения анализа необходимо использовать специальные технологии управления workflow, которые могут оптимизировать проектирование и выполнение процессов с помощью высокопроизводительных вычислительных машин. Цель работы - создать инструмент, с помощью которого можно получать корректные скрипты на языке WDL, не вдаваясь в специфику языка. Чтобы получить результат пользователь должен работать исключительно в среде с графическим интерфейсом. Приложение также должно осуществлять обратный процесс - получение графической интерпретации WDL-скрипта.