Details

Title: Анализ и разработка генератора и парсера скриптов на языке WDL: магистерская диссертация: 09.04.04
Creators: Вавилова Мария Андреевна
Scientific adviser: Котляров Всеволод Павлович
Organization: Санкт-Петербургский политехнический университет Петра Великого. Институт компьютерных наук и технологий
Imprint: Санкт-Петербург, 2017
Collection: Выпускные квалификационные работы; Общая коллекция
Subjects: Интерфейсы; Вычислительные машины электронные — Применение в биологии и медицине; Программирования языки; технологии управления; корректные скрипты; графический интерфейс
UDC: 004.514(043.3); 004.9:57(043.3); 004.434:5(043.3)
Document type: Master graduation qualification work
File type: PDF
Language: Russian
Level of education: Master
Speciality code (FGOS): 09.04.04
Speciality group (FGOS): 090000 - Информатика и вычислительная техника
DOI: 10.18720/SPBPU/2/v17-2119
Rights: Доступ по паролю из сети Интернет (чтение, печать, копирование)
Record key: RU\SPSTU\edoc\39649

Allowed Actions:

Action 'Read' will be available if you login or access site from another network Action 'Download' will be available if you login or access site from another network

Group: Anonymous

Network: Internet

Annotation

Магистерская диссертация посвящена разработке инструментария для проведения экспериментальных исследований в новом научном направлении - молекулярной медицине, в котором проблемы диагностики, профилактики и лечения решаются на молекулярном уровне при помощи анализа нуклеиновых кислот - ДНК, РНК и продуктов их экспрессии (белков). В настоящее время для проведения анализа специалистам по биоинформатике необходимо взаимодействовать с инфраструктурой, состоящей из высокопроизводительных вычислительных ресурсов, крупномасштабного хранилища и эфффективных инструментов. Как правило, анализы осуществляется несколькими программными инструментами, обрабатывающими последовательно входные данные. Этапы анализа обычно выполняются на сервере или кластере, пригодном для многоступенчатой обработки больших данных. Для эффективного проведения анализа необходимо использовать специальные технологии управления workflow, которые могут оптимизировать проектирование и выполнение процессов с помощью высокопроизводительных вычислительных машин. Цель работы - создать инструмент, с помощью которого можно получать корректные скрипты на языке WDL, не вдаваясь в специфику языка. Чтобы получить результат пользователь должен работать исключительно в среде с графическим интерфейсом. Приложение также должно осуществлять обратный процесс - получение графической интерпретации WDL-скрипта.

Document access rights

Network User group Action
ILC SPbPU Local Network All Read Print Download
Internet Authorized users SPbPU Read Print Download
-> Internet Anonymous

Usage statistics

stat Access count: 577
Last 30 days: 0
Detailed usage statistics