Детальная информация

Название: Анализ данных, полученных в результате секвенирования генома человека: бакалаврская работа: 01.03.02
Авторы: Кузнецов Павел Сергеевич
Научный руководитель: Иванков Алексей Александрович
Организация: Санкт-Петербургский политехнический университет Петра Великого. Институт прикладной математики и механики
Выходные сведения: Санкт-Петербург, 2017
Коллекция: Выпускные квалификационные работы; Общая коллекция
Тематика: секвенирование; сигнал покрытия прочтениями; энтропия; вейвлет-преобразование
Тип документа: Выпускная квалификационная работа бакалавра
Тип файла: PDF
Язык: Русский
Уровень высшего образования: Бакалавриат
Код специальности ФГОС: 01.03.02
Группа специальностей ФГОС: 010000 - Математика и механика
DOI: 10.18720/SPBPU/2/v17-6585
Права доступа: Доступ по паролю из сети Интернет (чтение, печать, копирование)
Ключ записи: RU\SPSTU\edoc\48824

Разрешенные действия:

Действие 'Прочитать' будет доступно, если вы выполните вход в систему или будете работать с сайтом на компьютере в другой сети Действие 'Загрузить' будет доступно, если вы выполните вход в систему или будете работать с сайтом на компьютере в другой сети

Группа: Анонимные пользователи

Сеть: Интернет

Аннотация

Настоящая работа посвящена анализу данных, полученных в результате секвенирования генома человека. Актуальность работы заключается в том, что имея только сигнал покрытия прочтениями можно будет сделать вывод о наличии и локализации аберраций генома. Исследована возможность использования энтропии как инвариантной оценки (относительно референсного генома) сигнала покрытия прочтениями. С помощью разработанного программного обеспечения были получены: оценки математического ожидания и дисперсии для сигнала покрытия прочтениями, оценки энтропии для исходного сигнала покрытия прочтениями, оценки спектральной плотности исходного сигнала и сигнала, полученного в результате вейвлет-преобразования исходных данных. Идентифицированы выбросы за уровень двух (трех) среднеквадратических отклонений для каждой из вышеперечисленных оценок. Они являются исходными данными для последующего анализа специалистами-генетиками результатов секвенирования на предмет наличия мутаций в этих геномах.

Права на использование объекта хранения

Место доступа Группа пользователей Действие
Локальная сеть ИБК СПбПУ Все Прочитать Печать Загрузить
Интернет Авторизованные пользователи СПбПУ Прочитать Печать Загрузить
-> Интернет Анонимные пользователи

Статистика использования

stat Количество обращений: 149
За последние 30 дней: 0
Подробная статистика