Детальная информация

Кузнецов, Павел Сергеевич. Анализ данных, полученных в результате секвенирования генома человека [Электронный ресурс]: бакалаврская работа: 01.03.02 / П. С. Кузнецов; Санкт-Петербургский политехнический университет Петра Великого, Институт прикладной математики и механики ; науч. рук. А. А. Иванков. — Электрон. текстовые дан. (1 файл : 10,8 Мб). — Санкт-Петербург, 2017. — Загл. с титул. экрана. — Свободный доступ из сети Интернет (чтение). — Adobe Acrobat Reader 7.0. — <URL:http://elib.spbstu.ru/dl/2/v17-6585.pdf>. — <URL:http://doi.org/10.18720/SPBPU/2/v17-6585>.

Дата создания записи: 17.11.2017

Тематика: секвенирование; сигнал покрытия прочтениями; энтропия; вейвлет-преобразование

Коллекции: Выпускные квалификационные работы; Общая коллекция

Ссылки: DOI

Разрешенные действия: Прочитать Для чтения документа необходим Flash Player

Группа: Анонимные пользователи

Сеть: Интернет

Аннотация

Настоящая работа посвящена анализу данных, полученных в результате секвенирования генома человека. Актуальность работы заключается в том, что имея только сигнал покрытия прочтениями можно будет сделать вывод о наличии и локализации аберраций генома. Исследована возможность использования энтропии как инвариантной оценки (относительно референсного генома) сигнала покрытия прочтениями. С помощью разработанного программного обеспечения были получены: оценки математического ожидания и дисперсии для сигнала покрытия прочтениями, оценки энтропии для исходного сигнала покрытия прочтениями, оценки спектральной плотности исходного сигнала и сигнала, полученного в результате вейвлет-преобразования исходных данных. Идентифицированы выбросы за уровень двух (трех) среднеквадратических отклонений для каждой из вышеперечисленных оценок. Они являются исходными данными для последующего анализа специалистами-генетиками результатов секвенирования на предмет наличия мутаций в этих геномах.

Права на использование объекта хранения

Место доступа Группа пользователей Действие
Локальная сеть ИБК СПбПУ Все Прочитать
-> Интернет Все Прочитать

Статистика использования документа

stat Количество обращений: 122
За последние 30 дней: 0
Подробная статистика