Объектом исследования является ФГУП «НИТИ им. А. П. Александрова». Целью выпускной квалификационной работы является изучение и анализ обоснованности исчисления налоговой базы по налогу на прибыль и налогу на добавленную стоимость в коммерческой организации (на примере ФГУП «НИТИ им. А. П. Александрова»). Для изучения вопросов использовались данные по учету в организации, законодательство Российской Федераций, а также письма ФНС и Арбитражная практика. Была дана характеристика организации, изучен вид деятельности, осуществляемые операции, структура организации и ее органов управления, экономические показатели организации за 3 последних года и их анализ в динамике, расчет финансовых показателей, краткая характеристика бухгалтерского учета, налогообложения. Был проведен анализ исчисления налоговой базы по налогу на прибыль и НДС с позиции обоснованности получения налогоплательщиком налоговой выгоды.