Детальная информация

Данная работа приурочена к разработке инструментария с целью выполнения экспериментальных исследований в новейшем академическом течении - молекулярной медицине, в котором трудности диагностики, профилактики и излечения решаются на молекулярном уровне при помощи анализа нуклеиновых кислот - ДНК, РНК и продуктов их экспрессии (белков). В сегодняшний день время для проведения анализа экспертами по биоинформатике необходимо взаимодействовать с инфраструктурой, состоящей из высокопроизводительных вычислительных ресурсов, крупномасштабного хранилища и эффективных инструментов. Как правило, анализы осуществляется несколькими программными инструментами, обрабатывающими поочередно входные данные. Этапы рассмотрения, как правило, производятся в сервере либо кластере, пригодном для многоступенчатой обработки крупной информации. Для эффективного выполнения анализа необходимо использовать специализированные технологии управления workflow, которые могут улучшить проектирование и выполнение процессов с помощью высокопроизводительных вычислительных машин. Цель работы - создать инструмент, с помощью которого можно получать корректные скрипты на языке WDL, никак не вдаваясь в специфику языка. Для того чтобы получить результат пользователь должен работать только в среде с графическим дизайном. Приложение также обязано реализовывать обратный процесс - получение графической интерпретации WDL-скрипта.