Детальная информация

Исследование конфигурационных свойств белковых молекул является важным шагом на пути к пониманию механизма их действия. Проведено компьютерное моделирование методом полноатомной молекулярной динамики катионного полипептида LAH4 в водной среде с разными значениями pH с целью изучения его структурных особенностей, поскольку известно, что способность LAH4 образовывать комплексы с молекулами ДНК зависит от уровня pH. Результаты моделирования показывают, что при использовании силового поля Amber ff99sb*-ildn в сочетании с 0,15 М раствором NaCl наблюдается образование различающихся вторичных структур в случае нейтральных и заряженных боковых групп остатков гистидина. В работе обсуждаются также конформационная динамика и стабильность полученных структур.