Details

Коробкина, Екатерина Александровна. Разработка и оптимизация методов ОТ-ПЦР анализа микроРНК [Электронный ресурс] = Development and optimization of methods of RT-PCR analysis of microRNA: выпускная квалификационная работа бакалавра: 16.03.01 - Техническая физика ; 16.03.01_06 - Медицинская и биоинженерная физика / Е. А. Коробкина; Санкт-Петербургский политехнический университет Петра Великого, Институт биомедицинских систем и биотехнологий ; науч. рук. Д. И. Богомаз ; консультант по нормоконтролю В. П. Октябрьский. — Электрон. текстовые дан. (1 файл : 1,3 Мб). — Санкт-Петербург, 2019. — Загл. с титул. экрана. — Свободный доступ из сети Интернет (чтение, печать, копирование). — Adobe Acrobat Reader 7.0. — <URL:http://elib.spbstu.ru/dl/3/2019/vr/vr19-1427.pdf>. — <URL:http://doi.org/10.18720/SPBPU/3/2019/vr/vr19-1427>. — <URL:http://elib.spbstu.ru/dl/3/2019/vr/rev/vr19-1427-o.pdf>. — <URL:http://elib.spbstu.ru/dl/3/2019/vr/rev/vr19-1427-a.pdf>.

Record create date: 10/4/2019

Subject: микроРНК; ОТ-ПЦР; биомаркеры; сравнительный анализ; праймеры; microRNA; RT-qPCR; biomarkers; comparative analysis; primers

Collections: Выпускные квалификационные работы; Общая коллекция

Links: DOI; Отзыв руководителя; Отчет о проверке на объем и корректность внешних заимствований

Allowed Actions: Read Download (1.3 Mb) You need Flash Player to read document

Group: Anonymous

Network: Internet

Annotation

МикроРНК – класс малых молекул – перспективных биомаркеров, ре-гулирующих экспрессию генов на посттранскрипционном уровне. Многие патологические процессы сопровождаются изменением профиля микроРНК в клетках. В данной работе описаны методы выделения микроРНК из различ-ных биологических образцов. Приведены описания основных методов ОТ-ПЦР анализа, применимых для микроРНК. Эти методы ОТ-ПЦР анализа бы-ли применены на практике, для каждого была определена оптимальная об-ласть применения. Разработан и оптимизирован наиболее приемлемый метод анализа микроРНК в клинических образцах.

MicroRNA is a class of small molecules - promising biomarkers which regu-late gene expression at the posttranscriptional level. Many pathological processes are accompanied by a change in the profile of miRNA in cells. In the given work methods of isolating miRNA from various biological samples are described. The descriptions of the main methods of RT-qPCR analysis applicable for miRNA are given. These methods of RT-qPCR analysis were applied in practice, the scope for each method was specified. The most acceptable method of miRNA analysis in clinical samples was developed and optimized.

Document access rights

Network User group Action
FL SPbPU Local Network All Read Print Download
-> Internet All Read Print Download

Table of Contents

  • диплом файнал
  • РЕФЕРАТ
    • РЕФЕРАТ
    • THE ABSTRACT
  • диплом файнал
    • Список использованных сокращений
    • ВВЕДЕНИЕ
    • 1.2. Жидкофазные методы
    • 1.2.1. Специфичное выделение
    • 1.2.2. Одновременное выделение РНК и ДНК
    • 1.3. Твердофазные методы
    • 1.3.1. Магнитная сепарация
    • 1.3.2. Выделение с помощью спин-колонок
    • ГЛАВА 2. ОТ-ПЦР МЕТОДЫ АНАЛИЗА МИКРОРНК
    • 2.1 Основные сведения о ПЦР
    • 2.1.1 Этапы ПЦР
    • 2.1.2. Способы оценки эффективности ПЦР
    • 2.2. Варианты «универсалъной» ОТ, применимые для миркоРНК
    • 2.2.1. Полиаденилирование (синтез поли-А хвоста)
    • 2.2.2. Универсальная элонгация и последующий ОТ-ПЦР анализ
    • 2.3. Варианты «специфичной» ОТ, применимые для миркоРНК
    • 2.3.1. Stem-loop метод ОТ-ПЦР анализа
    • 2.3.2. Two-tail метод ОТ-ПЦР
    • ГЛАВА 3. ПРОВЕДЕНИЕ ЭКСПЕРИМЕНТОВ С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ РАЗЛИЧНЫХ МЕТОДОВ ОТ-ПЦР АНАЛИЗА. РЕЗУЛЬТАТЫ ИССЛЕДОВАНИЯ
    • 3.1. Методы выделения
    • 3.1.1. Выделение тотальной РНК из культур клеток
    • 3.1.2. Выделение РНК из тонкоигольной аспирационной биопсии (ТАБ)
    • 3.1.3. Выделение РНК из гистологических срезов
    • 3.2. Результаты
    • 3.2.1. Динамический диапазон регистрации синтетической микроРНК-451
    • 3.2.2. Анализ экспрессии различных микроРНК в клеточных линиях
    • 3.2.3. Анализ экспрессии различных микроРНК в клинических образцах
    • ГЛАВА 4. ПРИМЕНЕНИЕ МЕТОДА TWO-TAIL В КЛИНИЧЕСКИХ ИССЛЕДОВАНИЯХ 4.1. Выбор потенциально маркерных микроРНК путем широкого скрининга (cancer-related miRNA panel)
    • 4.2. Применение метода two-tail для диагностики клинических образцов
    • ЗАКЛЮЧЕНИЕ
    • Список использованных источников
    • Приложение 1. Последовательности олигонуклеотидов
    • Приложение 2. Значения Сt анализа образцов аденокарциномы и список детектируемых микроРНК
    • Приложение 3. Значения Сt анализа образцов очаговых псевдотуморозных образований и список детектируемых микроРНК

Document usage statistics

stat Document access count: 22
Last 30 days: 4
Detailed usage statistics