Проведено исследование ассоциации между полиморфными вариантами R61C и 420del гена SLC22A1, и rs2289669 гена SLC47A1 и толерантностью к метформину при лечении диабета второго типа в популяции Северо-Западного региона РФ. Также было выполнено полногеномное генотипирование с использованием чипов GSA, с целью определить генетические варианты, ассоциированные с возникновением/отсутствием ответа на терапию метформином. В качестве объекта исследования была выбрана ДНК, выделенная методом фенольно-хлороформной экстракции из цельной венозной крови. В качестве методов исследования использовались: ПЦР, обработка эндонуклеазами рестрикции, визуализация продуктов в полиакриламидном геле, полногеномное генотипирование с использованием чипов GSA, а также методы биоинформатического и статистического анализа. В результате выполнения работы были впервые проанализированы частоты данных полиморфных вариантов в популяции Северо-Западного региона РФ. Было показано отсутствие связи между наличием вариантов R61C и 420del гена SLC22A1, и rs2289669 гена SLC47A1 и отсутствием эффекта от приёма метформина. Были обнаружены генетические варианты, которые потенциально ассоициированы с отсутствием эффекта от приёма метформина, а именно rs7178601, rs78721842, rs28493319, rs28674959 гена AGBL1 и rs17640893, rs73142962 гена COX7B2.

An association study was conducted between the polymorphic variants R61C and 420del of the SLC22A1 gene and rs2289669 of the SLC47A1 gene and metformin tolerance in the treatment of type 2 diabetes in a population of the North-West region of the Russian Federation. Genome-wide genotyping using GSA chips was also performed to determine the genetic variants associated with the occurrence/absence of a response to metformin therapy. Object of study was DNA isolated by phenol-chloroform extraction from whole venous blood. The research methods used: PCR, restriction endonuclease treatment, visualization of products in a polyacrylamide gel, genome-wide genotyping using GSA chips and bioinformatics and statistics methods. Results: the frequencies of the polymorphisms in the population of the North-West region of Russian Federation were first analyzed. No connection was shown between the presence of R61C and 420del polymorphisms of the SLC22A1 gene and rs2289669 of the SLC47A1 gene and the tolerance to metformin. Genetic variants that are potentially associated with the lack of the effect from taking metformin such as rs7178601, rs78721842, rs28493319, rs28674959 of the AGBL1 gene rs17640893, rs73142962 of the COX7B2 gene have been discovered.

• РЕФЕРАТ
• ABSTRACT
• СОДЕРЖАНИЕ
• ВВЕДЕНИЕ
• ГЛАВА 1. ЛИТЕРАТУРНЫЙ ОБЗОР
  • 1.1 Диабет второго типа
  • 1.2 Клиническая фармакогенетика
  • 1.3 Метформин
  • 1.4 Ген SLC22A1 (белок OCT1)
  • 1.5 Ген SLC47A1 (белок MATE1)
• ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
  • 2.1 Материалы исследования
  • 2.2 Методы
    • 2.2.1 Экстракция геномной ДНК из лимфоцитов периферической крови.
    • 2.2.2 ПЦР анализ
  • 2.2.3 Полногеномное генотипирование с использованием чипов GSA.
• ГЛАВА 3. РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ
  • 3.1 Сравнение контрольной группы и группы с диабетом второго типа
  • 3.2 Сравнение групп с различным эффектом от употребления метформина при диабете.
  • 3.3 Результаты полногеномного генотипирование с использованием чипов GSA (Illumina)
• ЗАКЛЮЧЕНИЕ
• СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ
• 41. B Van der Schueren, R Vangoitsenhoven, B Geeraert. Low cytochrome oxidase 4I1 links mitochondrial dysfunction to obesity and type 2 diabetes in humans and mice.// International journal of obesity. - 2015. - 39. – 1254-63.