Бакалаврская работа «Аллельные варианты и экспрессия гена SCARB2 в патогенезе болезни Паркинсона» посвящена оценке ассоциаций однонуклеотидных полиморфизмов (ОНП) rs6812193 и rs8475 гена SCARB2 с риском и возрастом начала болезни Паркинсона (БП) в Северо-Западном регионе России. В ходе работы был разработан молекулярно-генетический метод идентификации ОНП rs6812193 и rs8475 гена SCARB2, осуществлен скрининг однонуклеотидных полиморфизмов (ОНП) rs6812193 и rs8475 гена SCARB2, а также оценена экспрессия гена SCARB2 в группе пациентов с БП и в также в контрольной группе (группа индивидуумов без неврологических заболеваний). Данное исследование впервые выявило связь rs8475 SCARB2 с БП: вариант TT rs8475 гена SCARB2 увеличивает риск развития БП в два раза. rs6812193 не ассоциирован с риском БП. rs6812193 и rs8475 гена SCARB2 не являются генетическим модификатором возраста начала БП и не влияют на уровень экспрессии SCARB2 в CD45 + клетках крови. При выполнении бакалаврской работы были разработаны праймеры и зонды для ПЦР и ПЦР в режиме реального времени с помощью программ Vector NTI и Primer3. Проведены следующие эксперименты: полимеразная цепная реакция (ПЦР) с последующим рестрикционным анализом, электрофорез фрагментов в полиакриламидном геле, аллель-специфичная ПЦР в режиме реального времени, количественная ПЦР в режиме реального времени, секвенирование, статистическая обработка данных.

Bachelor's work “Allelic variants and expression of the SCARB2 gene in the pathogenesis of Parkinson's disease” is devoted to assessing of the associations of single nucleotide polymorphisms (SNPs) rs6812193 and rs8475 of the SCARB2 gene with risk and age at onset of Parkinson's disease (PD) in the North-West region of Russia. In the current work method for identifying of SNPs rs6812193 and rs8475 of the SCARB2 gene was designed. rs6812193 and rs8475 of the SCARB2 gene were genotyped in the group of patients with PD and controls. The current study revealed for the first time association rs8475 of SCARB2 with PD: TT variant of rs8475 of the SCARB2 gene increase twice risk of PD. No association of rs6812193 with PD risk was found for Russian population. rs6812193 and rs8475 polymorphisms of SCARB2 are not genetic modifier of age at onset of PD and do not influence on SCARB2 expression level in CD45+ blood cells. In thus bachelor's work sequences of primers for genotyping of studied SNPs and estimating of SCARB2 mRNA level were designed by Vector NTI and Primer3 programs. The following experiments were carried out: polymerase chain reaction (PCR)–restriction fragment length polymorphism method, allele-specific real-time PCR, real-time PCR, direct sequencing of DNA sample with forward and reverse primers, and statistical analysis.

• СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ
• ВВЕДЕНИЕ
• ГЛАВА 1. АНАЛИТИЧЕСКИЙ ОБЗОР
  • 1.1. Общие представления об этиологии и эпидемиологии БП
  • 1.2. Гены предрасположенности к развитию БП
  • 1.3. Гены лизосомных ферментов и белков в патогенезе БП
  • 1.4. Ген SCARB2
• ГЛАВА 2. ЦЕЛЬ И ЗАДАЧИ ИССЛЕДОВАНИЯ
• ГЛАВА 3. ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНАЯ ЧАСТЬ
  • 3.1. Приборы и оборудования
  • 3.2. Характеристика обследованных групп
  • 3.3. Выделение ДНК из лейкоцитов периферической крови человека
  • 3.4. Полимеразная цепная реакция и рестрикционный анализ для идентификации ОНП rs6812193 в гене SCARB2
  • 3.5. Идентификация ОНП rs8475 в гене SCARB2
  • 3.6. Выделение CD45+ клеток периферической крови
  • 3.7. Оценка относительного уровня мРНК гена SCARB2 в CD45+клетках периферической крови
  • 3.8. Статистическая обработка данных
  • 3.9. Техническое обеспечение
    • 3.9.1. Пакет программ R
    • 3.9.2. Пакет программ Haploview
    • 3.9.3 Пакет программ Primer3
    • 3.9.4. Пакет программ Vector NTI
    • 3.9.5. Пакет программ SPSS
• ГЛАВА 4. РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ
  • 4.1. rs6812193 гена SCARB2
  • 4.2. rs8475 гена SCARB2
  • 4.3.Экспрессия гена SCARB2 в CD45+ клетках периферической крови
  • 4.4. Анализ взаимодействия ОНП rs6812193, rs8475 и экспрессии гена SCARB2
  • 4.5. Ассоциация ОНП rs8475 и rs6812193 гена SCARB2 с возрастом начала БП
• ЗАКЛЮЧЕНИЕ И ВЫВОДЫ
• СПИСОК ИСПОЛЬЗОВАННЫХ ИСТОЧНИКОВ