Тема выпускной квалификационной работы: «Новый антибиотик аурапланин влияет на термодинамику А-сайтового взаимодействия в бактериальной рибосоме». Данная работа посвящена исследованию влияния антибиотика аурапланина на парциальные реакции цикла элонгации в бактериальной рибосоме. С помощью реконструированной in vitro системы синтеза белка из E.coli был определён ряд термодинамических и кинетических параметров А-сайтового взаимодействия. Проведение экспериментов методом остановленного потока позволило изучить престационарную кинетику связывания аминоацил-тРНК в А сайте и престационарную кинетику транслокации рибосомы. Помимо этого, было оценено влияние ауралпанина на образование первой пептидной связи.

The subject of the graduate qualification work is “A new antibiotic auraplanin affects the thermodynamics of the A-site interaction in the bacterial ribosome”. The given work is devoted to the study of the effect of the antibiotic auraplanin on partial reactions of the elongation cycle in the bacterial ribosome. Several of thermodynamic and kinetic parameters of the A-site interaction were determined by using the reconstructed in vitro protein synthesis system from E. coli. Experiments provided by the stopped flow method made possible to study the presteady state kinetics of aminoacyl-tRNA binding at the A site and the presteady state kinetics of ribosome translocation. In addition, the effect of auralpanin on the formation of the first peptide bond was evaluated.