Details

Title: Сравнительная характеристика методов выделения нуклеиновых кислот из образцов зубного налета: выпускная квалификационная работа бакалавра: направление 19.03.01 «Биотехнология» ; образовательная программа 19.03.01_03 «Биотехнология (общий профиль)»
Creators: Образцова Ольга
Scientific adviser: Аронова Екатерина Борисовна
Organization: Санкт-Петербургский политехнический университет Петра Великого. Институт биомедицинских систем и биотехнологий
Imprint: Санкт-Петербург, 2023
Collection: Выпускные квалификационные работы; Общая коллекция
Subjects: нуклеиновые кислоты; методы выделения; зубной налет; ПЦР-РВ; nucleic acid; extraction methods; dental plaque; qPCR
Document type: Bachelor graduation qualification work
File type: PDF
Language: Russian
Level of education: Bachelor
Speciality code (FGOS): 19.03.01
Speciality group (FGOS): 190000 - Промышленная экология и биотехнологии
DOI: 10.18720/SPBPU/3/2023/vr/vr23-3577
Rights: Доступ по паролю из сети Интернет (чтение)
Record key: ru\spstu\vkr\24702

Allowed Actions:

Action 'Read' will be available if you login or access site from another network

Group: Anonymous

Network: Internet

Annotation

Цель работы – сравнить различные методы выделения нуклеиновых кислот из образцов зубного налета человека.  Задачи, которые решались в ходе исследования: 1. Изучение литературных данных по микробиоте ротовой полости. 2. Выделение нуклеиновых кислот из образцов зубного налета методами спиртового осаждения, сорбции на частицах силикагеля, сорбции на магнитных частицах и термического лизиса. 3. Постановка ПЦР в режиме реального времени с праймерами к гену MGL. 4. Анализ полученных данных. Объектами данного исследования выбраны наборы, применяемые для раз-личных методов выделения нуклеиновых кислот производителя ГК «Алкор Био». Предметом исследования является качественная и количественная характеристика нуклеиновых кислот, выделенных разными методами. При написании литературного обзора использовались следующие базы данных: eLIBRARY.RU. Scopus, NCBI.  В ходе исследования была проведена экстракция нуклеиновых кислот из образцов зубного налета следующими методами: спиртовое осаждение, термический лизис, сорбция на частицах силикагеля, сорбция на магнитных частицах. Для анализа результатов экстракции поставлена ПЦР в реальном времени и получены кривые флуоресценции. Статистическую обработку экспериментальных данных осуществляли с использованием пакета программ Microsoft Excel. На основе полученных данных выяснено, что для проведения анализа нуклеиновых кислот из образцов зубного налета наиболее подходящим является набор «Магно-НК-Био».

The purpose of this work is to compare different methods nucleic acid extraction from human plaque samples. The tasks of this study were as follows: 1. Study of literature on the microbiota of the oral cavity. 2. Nucleic acid extraction from plaque samples by ethanol precipitation, adsorp-tion on silica gel particles, adsorption on magnetic particles and thermal lysis. 3. Conduction of real-time PCR using primers for the MGL gene. 4. Analysis of the received data. The objects of this study were kits used for various methods of nucleic acid ex-traction made by Alkor Bio Group. The subject of the study is the qualitative and quantitative characteristics of nucleic acids isolated by different methods. When writing the literature review, the following databases were used: eLI-BRARY.RU, Scopus, NCBI. During the study, nucleic acid was extracted from plaque samples by the following methods: ethanol precipitation, thermal lysis, adsorption on silica gel particles, and adsorption on magnetic particles. To analyze the extraction results, real-time PCR was performed and fluorescence curves were obtained. Statistical processing of experimental data was carried out using the Microsoft Excel software package. Based on the obtained data, it was found that the «Magno-NK-Bio» kit is the most suitable for nucleic acid analysis in dental plaque samples.

Document access rights

Network User group Action
ILC SPbPU Local Network All Read
Internet Authorized users SPbPU Read
-> Internet Anonymous

Table of Contents

  • ВВЕДЕНИЕ
  • 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
  • 1.1. Нормальная и патогенная микрофлора ротовой полости
  • 1.2. Микробиота зубного налета и зубной бляшки
  • 1.4. Ферментативная активность ротовой полости при нормальных и
  • патологических состояниях
  • 1.3. Микробиота при патологических процессах в ротовой полости
  • 2. ОБЪЕКТЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ
  • 2.1. Объект и предмет исследования
  • 2.2. Материалы и оборудование
  • 2.3. Методы исследования
  • 2.3.1. Спиртовое осаждение
  • 2.3.2. Сорбция на частицах силикагеля
  • 2.3.3. Сорбция на магнитных частицах
  • 2.3.4. Термический лизис
  • 2.3.5. ПЦР в реальном времени
  • 2.4. Математическая обработка результатов
  • 2.5. Схема проведения эксперимента
  • 3. РЕЗУЛЬТАТЫ ИССЛЕДОВАНИЙ И ИХ ОБСУЖДЕНИЕ
  • 3.1. Результаты ПЦР-РВ, снятые с амплификатора LightCycler 96 Roche
  • 3.2. Результаты ПЦР-РВ, снятые с амплификатора BioRAD CFX 96
  • 4. ОБЕСПЕЧЕНИЕ БЕЗОПАСНОСТИ УСЛОВИЙ ТРУДА
  • 4.1. Анализ опасных и вредных производственных факторов
  • 4.2. Мероприятия по пожаро- и взрывоопасности
  • ЗАКЛЮЧЕНИЕ
  • СПИСОК ИСПОЛЬЗОВАННЫХ СОКРАЩЕНИЙ
  • СПИСОК ИСПОЛЬЗУЕМЫХ ИСТОЧНИКОВ
  • ПРИЛОЖЕНИЕ А
  • ПРИЛОЖЕНИЕ Б

Usage statistics

stat Access count: 32
Last 30 days: 14
Detailed usage statistics