Детальная информация

Название: Методы анализа сигнальных потоков в сигнальных сетях: выпускная квалификационная работа бакалавра: направление 01.03.02 «Прикладная математика и информатика» ; образовательная программа 01.03.02_04 «Биоинформатика»
Авторы: Звездин Антон Владимирович
Научный руководитель: Гурский Виталий Валериевич
Организация: Санкт-Петербургский политехнический университет Петра Великого. Физико-механический институт
Выходные сведения: Санкт-Петербург, 2023
Коллекция: Выпускные квалификационные работы; Общая коллекция
Тематика: сигнальные сети; графы; распространение сигнала; относительная энтропия; signal networks; graphs; signal propagation; relative entropy
Тип документа: Выпускная квалификационная работа бакалавра
Тип файла: PDF
Язык: Русский
Уровень высшего образования: Бакалавриат
Код специальности ФГОС: 01.03.02
Группа специальностей ФГОС: 010000 - Математика и механика
DOI: 10.18720/SPBPU/3/2023/vr/vr23-4591
Права доступа: Доступ по паролю из сети Интернет (чтение, печать)
Ключ записи: ru\spstu\vkr\25348

Разрешенные действия:

Действие 'Прочитать' будет доступно, если вы выполните вход в систему или будете работать с сайтом на компьютере в другой сети

Группа: Анонимные пользователи

Сеть: Интернет

Аннотация

Целью работы являлось исследование топологии сигнальных сетей, обра-зованных биохимическими реакциями в живых системах и осуществляющих биологическую функцию передачи сигнала от одних молекул к другим. Исполь-зуя известный алгоритм оценки сигнального потока в таких сетях, был проведён анализ уникальности биологических сигнальный сетей по сравнению со случай-ными сетями с похожими топологическими характеристиками с точки зрения значения сигнального потока. Были предложены две характеристики сигнального потока для сравнения между биологической сетью и случайными сетями — зна-чение сигнального потока на выходном узле графа и среднее расстояние Кульба-ка–Лейблера между распределениями сигнального потока по всем узлам внутри данной сети и внутри случайной сети. Показано, что значения обеих характери-стик для нескольких рассмотренных биологических сетей статистически значимо отличаются от значений для множества сгенерированных случайных сетей. На основе полученных результатов можно сделать предположение о том, что пред-ложенные характеристики сигнальных потоков могут служить объектами эволю-ционного отбора, в результате которого сформировались структуры биологиче-ских сигнальных сетей как эффективных инструментов передачи сигнала.

The purpose of the work was to study the topology of signaling networks formed by biochemical reactions in living systems and performing the biological function of signal transmission from one molecule to another. Using the well-known algorithm for estimating the signal flow in such networks, an analysis was made of the uniqueness of biological signal networks in comparison with random networks with similar topological characteristics in terms of the value of the signal flow. Two characteristics of the signal flow were proposed for comparison between a biological network and random networks - the value of the signal flow at the output node of the graph and the average Kullback–Leibler distance between the distributions of the sig-nal flow over all nodes within a given network and within a random network. It is shown that the values of both characteristics for several considered biological net-works are statistically significantly different from the values for the set of generated random networks. Based on the results obtained, it can be assumed that the proposed characteristics of signal flows can serve as objects of evolutionary selection, which resulted in the formation of structures of biological signal networks as effective tools for signal transmission.

Права на использование объекта хранения

Место доступа Группа пользователей Действие
Локальная сеть ИБК СПбПУ Все Прочитать Печать
Интернет Авторизованные пользователи СПбПУ Прочитать Печать
-> Интернет Анонимные пользователи

Статистика использования

stat Количество обращений: 1
За последние 30 дней: 0
Подробная статистика