Диссертация Симаковой М.Н. посвящена актуальным для биомедицины исследованиям структуры и свойств вирусных фибриллярных белков и литических ферментов, а также ряда мембранных белков с помощью теоретических и экспериментальных методов. Цели работы достигались путем компьютерного анализа аминокислотных последовательностей белков для прогнозирования их вторичной структуры, получением целевых белков и экспериментальным исследованием их свойств.