Details

Title: Повышение эффективности системы хранения и управления геномными данными: магистерская диссертация
Creators: Белокопытова Елизавета Андреевна
Organization: Санкт-Петербургский политехнический университет Петра Великого. Институт компьютерных наук и технологий
Imprint: Санкт-Петербург, 2015
Collection: Выпускные квалификационные работы; Общая коллекция
Subjects: Вычислительные машины электронные — Применение в биологии и медицине; Биология
UDC: 004.6(043.3); 575.113(043.3)
File type: PDF
Language: Russian
Rights: Доступ по паролю из сети Интернет (чтение, печать, копирование)

Allowed Actions:

Action 'Read' will be available if you login or access site from another network Action 'Download' will be available if you login or access site from another network

Group: Anonymous

Network: Internet

Annotation

Объектом исследования в этой работе являются геномные данные и способы управления ими. Цель работы состоит в разработке открытой системы хранения и предоставления генетических данных с использованием методики индексации. При выполнении данной работы были решены следующие задачи: 1. Исследованы особенности структуры геномных данных и выбрана модель стандарта GA4GH2. Сформирована схемы представления модели метаданных, выбрана оптимальная в рамках задачи базы данных. 3. Разработана система предоставления геномных данных с индексацией. 4. Проведен сравнительный анализ результатов нагрузочного тестирования систем с индексацией и без неё, а также сравнение полученной системы с аналогами. Такая система может использоваться специалистами биоинформатики, например - в качестве сервера для геномного обозревателя. На её основе могут решаться сложные задачи различных, связанных с геномикой областей, например - медицины.

Document access rights

Network User group Action
ILC SPbPU Local Network All Read Print Download
Internet Authorized users Read Print Download
-> Internet Anonymous

Usage statistics

stat Access count: 642
Last 30 days: 0
Detailed usage statistics