В диссертационном исследовании рассматривается тема управления человеческим капиталом в интересах развития инновационной среды университета с учетом внедрения системы эффективных контрактов. Актуальность темы обусловлена декларированием курса государственной политики Российской Федерации в образовательной сфере, нацеленной на развитие методологии в области управления человеческим капиталом в целях инновационного развития университета. В работе представлена трансформация аналитической специфики человеческого капитала научно-исследовательского коллектива под влиянием процесса цифровизации экономики; рассмотрен сравнительный анализ методик оценки человеческого капитала; сформирован методический инструмент оценки профессиональной компоненты человеческого капитала научно-исследовательского коллектива; разработан методический инструмент оценки совместимости научно- исследовательского коллектива; разработана критериальная модель управления человеческим капиталом через систему эффективного контракта, сформированы рекомендации по внедрению системы эффективных контрактов в университете.