Детальная информация

Название: Адаптация инструмента поиска мутаций в геноме для технологии Spark: магистерская диссертация: 09.04.01
Авторы: Осенняя Дарья Игоревна
Научный руководитель: Дробинцев Павел Дмитриевич
Организация: Санкт-Петербургский политехнический университет Петра Великого. Институт компьютерных наук и технологий
Выходные сведения: Санкт-Петербург, 2016
Коллекция: Выпускные квалификационные работы; Общая коллекция
Тематика: Вычислительные машины электронные — Применение в биологии и медицине; биоинформатика; геномика; поиск мутаций; bioinformatics; genomics; variant calling
УДК: 004.9:57(043.3)
Тип документа: Выпускная квалификационная работа магистра
Тип файла: PDF
Язык: Русский
Код специальности ФГОС: 09.04.01
Группа специальностей ФГОС: 090000 - Информатика и вычислительная техника
DOI: 10.18720/SPBPU/2/v16-2299
Права доступа: Доступ по паролю из сети Интернет (чтение, печать, копирование)

Разрешенные действия:

Действие 'Прочитать' будет доступно, если вы выполните вход в систему или будете работать с сайтом на компьютере в другой сети Действие 'Загрузить' будет доступно, если вы выполните вход в систему или будете работать с сайтом на компьютере в другой сети

Группа: Анонимные пользователи

Сеть: Интернет

Аннотация

Данная диссертация посвящена адаптации инструмента поиска мутаций в геноме для его совместного использования с технологией Apache Spark. Описана предметная область, обоснована актуальность инструментов поиска мутаций и необходимость ускорения их работы. Приведён обзор инструментов для поиска мутаций, а также обзор технологии Apache Spark. Разработана и описана методика перевода инструмента поиска мутаций на Spark. Разработанная методика была реализована в инструменте VarDictSpark. Приведены графики сравнения производительности модифицированного и исходного инструментов.

Права на использование объекта хранения

Место доступа Группа пользователей Действие
Локальная сеть ИБК СПбПУ Все Прочитать Печать Загрузить
Интернет Авторизованные пользователи СПбПУ Прочитать Печать Загрузить
Интернет Авторизованные пользователи (не СПбПУ)
-> Интернет Анонимные пользователи

Статистика использования

stat Количество обращений: 36
За последние 30 дней: 0
Подробная статистика