Details

Title: Адаптация инструмента поиска мутаций в геноме для технологии Spark: магистерская диссертация: 09.04.01
Creators: Осенняя Дарья Игоревна
Scientific adviser: Дробинцев Павел Дмитриевич
Organization: Санкт-Петербургский политехнический университет Петра Великого. Институт компьютерных наук и технологий
Imprint: Санкт-Петербург, 2016
Collection: Выпускные квалификационные работы; Общая коллекция
Subjects: Вычислительные машины электронные — Применение в биологии и медицине; биоинформатика; геномика; поиск мутаций; bioinformatics; genomics; variant calling
UDC: 004.9:57(043.3)
Document type: Master graduation qualification work
File type: PDF
Language: Russian
Speciality code (FGOS): 09.04.01
Speciality group (FGOS): 090000 - Информатика и вычислительная техника
DOI: 10.18720/SPBPU/2/v16-2299
Rights: Доступ по паролю из сети Интернет (чтение, печать, копирование)

Allowed Actions:

Action 'Read' will be available if you login or access site from another network Action 'Download' will be available if you login or access site from another network

Group: Anonymous

Network: Internet

Annotation

Данная диссертация посвящена адаптации инструмента поиска мутаций в геноме для его совместного использования с технологией Apache Spark. Описана предметная область, обоснована актуальность инструментов поиска мутаций и необходимость ускорения их работы. Приведён обзор инструментов для поиска мутаций, а также обзор технологии Apache Spark. Разработана и описана методика перевода инструмента поиска мутаций на Spark. Разработанная методика была реализована в инструменте VarDictSpark. Приведены графики сравнения производительности модифицированного и исходного инструментов.

Document access rights

Network User group Action
ILC SPbPU Local Network All Read Print Download
Internet Authorized users Read Print Download
-> Internet Anonymous

Usage statistics

stat Access count: 38
Last 30 days: 0
Detailed usage statistics