Details
| Title | Адаптация инструмента поиска мутаций в геноме для технологии Spark: магистерская диссертация: 09.04.01 |
|---|---|
| Creators | Осенняя Дарья Игоревна |
| Scientific adviser | Дробинцев Павел Дмитриевич |
| Organization | Санкт-Петербургский политехнический университет Петра Великого. Институт компьютерных наук и технологий |
| Imprint | Санкт-Петербург, 2016 |
| Collection | Выпускные квалификационные работы ; Общая коллекция |
| Subjects | Вычислительные машины электронные — Применение в биологии и медицине ; биоинформатика ; геномика ; поиск мутаций ; bioinformatics ; genomics ; variant calling |
| UDC | 004.9:57(043.3) |
| Document type | Master graduation qualification work |
| Language | Russian |
| Level of education | Master |
| Speciality code (FGOS) | 09.04.01 |
| Speciality group (FGOS) | 090000 - Информатика и вычислительная техника |
| DOI | 10.18720/SPBPU/2/v16-2299 |
| Rights | Доступ по паролю из сети Интернет (чтение, печать, копирование) |
| Record key | RU\SPSTU\edoc\35124 |
| Record create date | 12/20/2016 |
Allowed Actions
–
Action 'Read' will be available if you login or access site from another network
Action 'Download' will be available if you login or access site from another network
| Group | Anonymous |
|---|---|
| Network | Internet |
Данная диссертация посвящена адаптации инструмента поиска мутаций в геноме для его совместного использования с технологией Apache Spark. Описана предметная область, обоснована актуальность инструментов поиска мутаций и необходимость ускорения их работы. Приведён обзор инструментов для поиска мутаций, а также обзор технологии Apache Spark. Разработана и описана методика перевода инструмента поиска мутаций на Spark. Разработанная методика была реализована в инструменте VarDictSpark. Приведены графики сравнения производительности модифицированного и исходного инструментов.
| Network | User group | Action |
|---|---|---|
| ILC SPbPU Local Network | All |
|
| Internet | Authorized users SPbPU |
|
| Internet | Anonymous |
|
Access count: 168
Last 30 days: 0
