Details

Настоящая диссертация посвящена изучению штаммов респираторно-синцитиального вируса человека, циркулировавших на территории Российской Федерации в 2014-2016 годах. Оценена изменчивость F-гена 24 изолятов РСВ, выделенных в Санкт-Петербурге в 2014 - 2016 гг., которые были отнесены к антигенной группе А (РСВ-А). По классификации, основанной на анализе структуры G-гена, все они принадлежат к генотипу ON1, отличительным признаком которого является инсерция 72 нуклеотидов в G-гене и который в настоящее время является доминирующим среди РСВ, циркулирующих во многих странах. С учетом результатов секвенирования F-гена в соответствии с критериями, предложенными в 2016 г. Кимурой с соавторами, большинство выделенных штаммов (кроме пяти не классифицируемых) были отнесены к генотипу GA2, для которого характерны аминокислотные замены (по сравнению со штаммом Long) V384I и N276S. Анализ мутаций F-гена позволил разделить выделенные нами РСВ на 2 группы. Большая часть оказалась близка к современным штаммам 2013-2017гг, информация о которых представлена в базе данных GenBank, и референсному вирусу генотипа ON1, далеко отойдя от вирусов-прародителей Long и А2. Пять штаммов, полученных в С.-Петербурге в 2014 г., составили особую «архаичную» группу, у которых структура F-белка приближена к вирусу Long. При сравнении с РСВ Long у всех исследованных изолятов была выявлена высокая частота замен во многих функционально значимых антигенных сайтах F-белка.