Details
Title | Изменчивость генов F и G штаммов респираторно-синцитиального вируса человека, выделенных в 2014-2016 годах в С.-Петербурге: магистерская диссертация: 16.04.01 |
---|---|
Creators | Синцова Ксения Сергеевна |
Scientific adviser | Грудинин М. П. |
Organization | Санкт-Петербургский политехнический университет Петра Великого. Институт физики, нанотехнологий и телекоммуникаций |
Imprint | Санкт-Петербург, 2017 |
Collection | Выпускные квалификационные работы ; Общая коллекция |
Subjects | вирусы ; секвенирование ; филогенетический анализ ; дыхательные пути |
UDC | 616.214.7(043.3) ; 578.7(043.3) |
Document type | Master graduation qualification work |
File type | |
Language | Russian |
Level of education | Master |
Speciality code (FGOS) | 16.04.01 |
Speciality group (FGOS) | 160000 - Физико-технические науки и технологии |
DOI | 10.18720/SPBPU/2/v17-2533 |
Rights | Доступ по паролю из сети Интернет (чтение, печать, копирование) |
Record key | RU\SPSTU\edoc\40197 |
Record create date | 8/22/2017 |
Allowed Actions
–
Action 'Read' will be available if you login or access site from another network
Action 'Download' will be available if you login or access site from another network
Group | Anonymous |
---|---|
Network | Internet |
Настоящая диссертация посвящена изучению штаммов респираторно-синцитиального вируса человека, циркулировавших на территории Российской Федерации в 2014-2016 годах. Оценена изменчивость F-гена 24 изолятов РСВ, выделенных в Санкт-Петербурге в 2014 - 2016 гг., которые были отнесены к антигенной группе А (РСВ-А). По классификации, основанной на анализе структуры G-гена, все они принадлежат к генотипу ON1, отличительным признаком которого является инсерция 72 нуклеотидов в G-гене и который в настоящее время является доминирующим среди РСВ, циркулирующих во многих странах. С учетом результатов секвенирования F-гена в соответствии с критериями, предложенными в 2016 г. Кимурой с соавторами, большинство выделенных штаммов (кроме пяти не классифицируемых) были отнесены к генотипу GA2, для которого характерны аминокислотные замены (по сравнению со штаммом Long) V384I и N276S. Анализ мутаций F-гена позволил разделить выделенные нами РСВ на 2 группы. Большая часть оказалась близка к современным штаммам 2013-2017гг, информация о которых представлена в базе данных GenBank, и референсному вирусу генотипа ON1, далеко отойдя от вирусов-прародителей Long и А2. Пять штаммов, полученных в С.-Петербурге в 2014 г., составили особую «архаичную» группу, у которых структура F-белка приближена к вирусу Long. При сравнении с РСВ Long у всех исследованных изолятов была выявлена высокая частота замен во многих функционально значимых антигенных сайтах F-белка.
Network | User group | Action |
---|---|---|
ILC SPbPU Local Network | All |
|
Internet | Authorized users SPbPU |
|
Internet | Anonymous |
|
Access count: 351
Last 30 days: 0