Details

Title Изменчивость генов F и G штаммов респираторно-синцитиального вируса человека, выделенных в 2014-2016 годах в С.-Петербурге: магистерская диссертация: 16.04.01
Creators Синцова Ксения Сергеевна
Scientific adviser Грудинин М. П.
Organization Санкт-Петербургский политехнический университет Петра Великого. Институт физики, нанотехнологий и телекоммуникаций
Imprint Санкт-Петербург, 2017
Collection Выпускные квалификационные работы ; Общая коллекция
Subjects вирусы ; секвенирование ; филогенетический анализ ; дыхательные пути
UDC 616.214.7(043.3) ; 578.7(043.3)
Document type Master graduation qualification work
File type PDF
Language Russian
Level of education Master
Speciality code (FGOS) 16.04.01
Speciality group (FGOS) 160000 - Физико-технические науки и технологии
DOI 10.18720/SPBPU/2/v17-2533
Rights Доступ по паролю из сети Интернет (чтение, печать, копирование)
Record key RU\SPSTU\edoc\40197
Record create date 8/22/2017

Allowed Actions

Action 'Read' will be available if you login or access site from another network

Action 'Download' will be available if you login or access site from another network

Group Anonymous
Network Internet

Настоящая диссертация посвящена изучению штаммов респираторно-синцитиального вируса человека, циркулировавших на территории Российской Федерации в 2014-2016 годах. Оценена изменчивость F-гена 24 изолятов РСВ, выделенных в Санкт-Петербурге в 2014 - 2016 гг., которые были отнесены к антигенной группе А (РСВ-А). По классификации, основанной на анализе структуры G-гена, все они принадлежат к генотипу ON1, отличительным признаком которого является инсерция 72 нуклеотидов в G-гене и который в настоящее время является доминирующим среди РСВ, циркулирующих во многих странах. С учетом результатов секвенирования F-гена в соответствии с критериями, предложенными в 2016 г. Кимурой с соавторами, большинство выделенных штаммов (кроме пяти не классифицируемых) были отнесены к генотипу GA2, для которого характерны аминокислотные замены (по сравнению со штаммом Long) V384I и N276S. Анализ мутаций F-гена позволил разделить выделенные нами РСВ на 2 группы. Большая часть оказалась близка к современным штаммам 2013-2017гг, информация о которых представлена в базе данных GenBank, и референсному вирусу генотипа ON1, далеко отойдя от вирусов-прародителей Long и А2. Пять штаммов, полученных в С.-Петербурге в 2014 г., составили особую «архаичную» группу, у которых структура F-белка приближена к вирусу Long. При сравнении с РСВ Long у всех исследованных изолятов была выявлена высокая частота замен во многих функционально значимых антигенных сайтах F-белка.

Network User group Action
ILC SPbPU Local Network All
Read Print Download
Internet Authorized users SPbPU
Read Print Download
Internet Anonymous

Access count: 351 
Last 30 days: 0

Detailed usage statistics