С 17 марта 2020 г. для ресурсов (учебные, научные, материалы конференций, статьи из периодических изданий, авторефераты диссертаций, диссертации) ЭБ СПбПУ, обеспечивающих образовательный процесс, установлен особый режим использования. Обращаем внимание, что ВКР/НД не относятся к этой категории.

Детальная информация

Название: Стохастическое моделирование молекулярных конфигураций регуляторных районов ДНК в эукариотических клетках: магистерская диссертация: 01.04.02
Авторы: Дмитренко Андрей Владимирович
Научный руководитель: Гурский Виталий Валериевич
Организация: Санкт-Петербургский политехнический университет Петра Великого. Институт прикладной математики и механики
Выходные сведения: Санкт-Петербург, 2017
Коллекция: Выпускные квалификационные работы; Общая коллекция
Тематика: Случайные процессы (мат.); Моделирование; регуляторные районы; транскрипционные факторы
УДК: 575.113/.118:519.2(043.3)
Тип документа: Выпускная квалификационная работа магистра
Тип файла: PDF
Язык: Русский
Код специальности ФГОС: 01.04.02
Группа специальностей ФГОС: 010000 - Математика и механика
DOI: 10.18720/SPBPU/2/v17-3308
Права доступа: Свободный доступ из сети Интернет (чтение, печать, копирование)

Разрешенные действия:

Действие 'Прочитать' будет доступно, если вы выполните вход в систему или будете работать с сайтом на компьютере в другой сети Действие 'Загрузить' будет доступно, если вы выполните вход в систему или будете работать с сайтом на компьютере в другой сети

Группа: Анонимные пользователи

Сеть: Интернет

Аннотация

Транскрипционные факторы (ТФ) регулируют активность генов посредством присоединения к ДНК в регуляторных районах. Комбинации связанных с ДНК факторов формируют молекулярные конфигурации, определяющие скорость транскрипции генов. В работе проводится стохастическое моделирование формирования молекулярных конфигураций регуляторных районов ДНК дрозофилы, влияющих на процесс эмбрионального развития. Моделирование основано на разработке и применении модифицированнои версии ранее предложенных моделеи. Модели этого процесса были исходно разработаны и исследованы на примере прокариотических систем и распространены на эукариотические клетки в представленной работе. Новая модель описывает процесс поиска молекулы ТФ своего саита посадки на ДНК с учетом механизма короткодеиствующеи репрессии, с помощью которого некоторые ТФ подавляют активность генов. Также в модели используется экспериментальная информация об областях открытого хроматина для более точного предсказания сайтов посадки ТФ на ДНК. Полученные результаты демонстрируют существенное влияние механизма короткодействующей репрессии на формирование молекулярных конфигураций. Это влияние заключается в уменьшении длин пробега молекул ТФ по ДНК, а также в уменьшении среднего времени занятости сайтов посадки ТФ. Расчеты свидетельствуют об отсутствии простой зависимости между энергией связи сайта посадки и вероятностью занятости этого сайта. Этот результат говорит о необходимости учета динамических особенностей молекулярных конфигураций в моделях экспрессии генов.

Права на использование объекта хранения

Место доступа Группа пользователей Действие
Локальная сеть ИБК СПбПУ Все Прочитать Печать Загрузить
Интернет Авторизованные пользователи Прочитать Печать Загрузить
-> Интернет Анонимные пользователи

Статистика использования

stat Количество обращений: 212
За последние 30 дней: 0
Подробная статистика