Login
Search manual

Details

Title Разработка генератора скриптов на языке WDL: выпускная квалификационная работа бакалавра: 09.03.02 - Информационные системы и технологии
Creators Валов Антон Олегович
Scientific adviser Пономарев Алексей Геннадьевич
Organization Санкт-Петербургский политехнический университет Петра Великого. Институт компьютерных наук и технологий
Imprint Санкт-Петербург, 2018
Collection Выпускные квалификационные работы ; Общая коллекция
Subjects IT-технологии ; интерфейсы ; языки программирования ; технологии управления ; генератор скриптов WDL
Document type Bachelor graduation qualification work
File type PDF
Language Russian
Level of education Bachelor
Speciality code (FGOS) 09.03.02
Speciality group (FGOS) 090000 - Информатика и вычислительная техника
Links Отзыв руководителя
DOI 10.18720/SPBPU/2/v18-6495
Rights Доступ по паролю из сети Интернет (чтение, печать, копирование)
Record key RU\SPSTU\edoc\59295
Record create date 12/10/2018

Allowed Actions

–

Action 'Read' will be available if you login or access site from another network

Action 'Download' will be available if you login or access site from another network

Group Anonymous
Network Internet

Данная работа приурочена к разработке инструментария с целью выполнения экспериментальных исследований в новейшем академическом течении - молекулярной медицине, в котором трудности диагностики, профилактики и излечения решаются на молекулярном уровне при помощи анализа нуклеиновых кислот - ДНК, РНК и продуктов их экспрессии (белков). В сегодняшний день время для проведения анализа экспертами по биоинформатике необходимо взаимодействовать с инфраструктурой, состоящей из высокопроизводительных вычислительных ресурсов, крупномасштабного хранилища и эффективных инструментов. Как правило, анализы осуществляется несколькими программными инструментами, обрабатывающими поочередно входные данные. Этапы рассмотрения, как правило, производятся в сервере либо кластере, пригодном для многоступенчатой обработки крупной информации. Для эффективного выполнения анализа необходимо использовать специализированные технологии управления workflow, которые могут улучшить проектирование и выполнение процессов с помощью высокопроизводительных вычислительных машин. Цель работы - создать инструмент, с помощью которого можно получать корректные скрипты на языке WDL, никак не вдаваясь в специфику языка. Для того чтобы получить результат пользователь должен работать только в среде с графическим дизайном. Приложение также обязано реализовывать обратный процесс - получение графической интерпретации WDL-скрипта.

Network User group Action
ILC SPbPU Local Network All
Read Print Download
Internet Authorized users SPbPU
Read Print Download
Internet Anonymous
  • Список используемых аббревиатур
  • Введение
  • Глава 1. Описание проблемы и постановка задачи
    • 1.1 Описание проблемы
    • 1.2 Подход к решению проблемы
    • 1.3 Анализ подходящих языков для специалистов по биоинформатике .
      • 1.3.1 Сравнительный анализ языков
      • Выводы:
    • 1.4 Сравнительный анализ технологий и инструментальных средств для реализации пайплайнов.
      • Выводы:
    • 1.5 Выводы по главе
    • 1.6 Постановка задачи
  • Глава 2 Основная концепция приложения
    • 2.1 Описание концепции приложения
    • 2.2 Некоторые пользовательские требования к приложению
    • 2.3 Архитектура приложения
    • 2.4 Стек технологий
    • 2.5 Выводы по главе 2
  • Глава 3 Описание реализации
    • 3.1 Особенности реализации
      • 3.1.1 Описание интерфейса
      • 3.1.2 Реализация сущностей
      • 3.1.3 Реализация связей
    • 3.2 Архитектура
      • 3.2.1 Иерархия классов
    • 3.3 Внешний программный интерфейс приложения (API)
    • 3.4 Тестирование
    • 3.5 Выводы по главе 3
  • Глава 4 Полученные результаты
    • 4.1 Статистика
    • 4.1.1 Статистика найденных ошибок
      • 4.1.2 Профилирование
    • 4.2 Не выполненные требования
    • 4.3 Выводы по главе 4
  • Заключение

Access count: 46 
Last 30 days: 0

Detailed usage statistics