Details
Title | Разработка генератора скриптов на языке WDL: выпускная квалификационная работа бакалавра: 09.03.02 - Информационные системы и технологии |
---|---|
Creators | Валов Антон Олегович |
Scientific adviser | Пономарев Алексей Геннадьевич |
Organization | Санкт-Петербургский политехнический университет Петра Великого. Институт компьютерных наук и технологий |
Imprint | Санкт-Петербург, 2018 |
Collection | Выпускные квалификационные работы ; Общая коллекция |
Subjects | IT-технологии ; интерфейсы ; языки программирования ; технологии управления ; генератор скриптов WDL |
Document type | Bachelor graduation qualification work |
File type | |
Language | Russian |
Level of education | Bachelor |
Speciality code (FGOS) | 09.03.02 |
Speciality group (FGOS) | 090000 - Информатика и вычислительная техника |
Links | Отзыв руководителя |
DOI | 10.18720/SPBPU/2/v18-6495 |
Rights | Доступ по паролю из сети Интернет (чтение, печать, копирование) |
Record key | RU\SPSTU\edoc\59295 |
Record create date | 12/10/2018 |
Allowed Actions
–
Action 'Read' will be available if you login or access site from another network
Action 'Download' will be available if you login or access site from another network
Group | Anonymous |
---|---|
Network | Internet |
Данная работа приурочена к разработке инструментария с целью выполнения экспериментальных исследований в новейшем академическом течении - молекулярной медицине, в котором трудности диагностики, профилактики и излечения решаются на молекулярном уровне при помощи анализа нуклеиновых кислот - ДНК, РНК и продуктов их экспрессии (белков). В сегодняшний день время для проведения анализа экспертами по биоинформатике необходимо взаимодействовать с инфраструктурой, состоящей из высокопроизводительных вычислительных ресурсов, крупномасштабного хранилища и эффективных инструментов. Как правило, анализы осуществляется несколькими программными инструментами, обрабатывающими поочередно входные данные. Этапы рассмотрения, как правило, производятся в сервере либо кластере, пригодном для многоступенчатой обработки крупной информации. Для эффективного выполнения анализа необходимо использовать специализированные технологии управления workflow, которые могут улучшить проектирование и выполнение процессов с помощью высокопроизводительных вычислительных машин. Цель работы - создать инструмент, с помощью которого можно получать корректные скрипты на языке WDL, никак не вдаваясь в специфику языка. Для того чтобы получить результат пользователь должен работать только в среде с графическим дизайном. Приложение также обязано реализовывать обратный процесс - получение графической интерпретации WDL-скрипта.
Network | User group | Action |
---|---|---|
ILC SPbPU Local Network | All |
|
Internet | Authorized users SPbPU |
|
Internet | Anonymous |
|
- Список используемых аббревиатур
- Введение
- Глава 1. Описание проблемы и постановка задачи
- 1.1 Описание проблемы
- 1.2 Подход к решению проблемы
- 1.3 Анализ подходящих языков для специалистов по биоинформатике .
- 1.3.1 Сравнительный анализ языков
- Выводы:
- 1.4 Сравнительный анализ технологий и инструментальных средств для реализации пайплайнов.
- Выводы:
- 1.5 Выводы по главе
- 1.6 Постановка задачи
- Глава 2 Основная концепция приложения
- 2.1 Описание концепции приложения
- 2.2 Некоторые пользовательские требования к приложению
- 2.3 Архитектура приложения
- 2.4 Стек технологий
- 2.5 Выводы по главе 2
- Глава 3 Описание реализации
- 3.1 Особенности реализации
- 3.1.1 Описание интерфейса
- 3.1.2 Реализация сущностей
- 3.1.3 Реализация связей
- 3.2 Архитектура
- 3.2.1 Иерархия классов
- 3.3 Внешний программный интерфейс приложения (API)
- 3.4 Тестирование
- 3.5 Выводы по главе 3
- 3.1 Особенности реализации
- Глава 4 Полученные результаты
- 4.1 Статистика
- 4.1.1 Статистика найденных ошибок
- 4.1.2 Профилирование
- 4.2 Не выполненные требования
- 4.3 Выводы по главе 4
- Заключение
Access count: 46
Last 30 days: 0