Details

Для выделения свободно циркулирующей ДНК были использованы образцы жидкостной биопсии 22 пациентов с НМРЛ с известным статусом сенсибилизирующей мутации в гене EGFR, проходящих лечение EGFR-ингибиторами. Выделение ДНК было проведено с использованием автоматизированной станции для выделения нуклеиновых кислот от компании Roche и набора от компании Qiagen. Статус гена EGFR оценивался с помощью различных методов: аллель-специфической ПЦР, с использованием набора Therascreen EGFR RGQ PCR, цифровой капельной ПЦР. В 12 случаях из 22 были определены первичные мутации в гене EGFR (ex19del и p.L858R) и в 7 образцах – резистентная мутация p.T790M. Также выполнено сравнение концентраций ДНК, выделенной разными методами, и чувствительности методик определения мутаций гена EGFR.

The study includes samples of free-circulating DNA from liquid biopsy of 22 patients with NSCLC. The extraction of free-circulating DNA was made using the automated station for isolation of NA from Roche company and the kit from Qiagen company. The status of the EGFR gene was assessed using a different methods: allele-specific PCR, the Therascreen EGFR RGQ PCR Kit, digital droplet PCR. Primary mutations of the EGFR gene (ex19del и p.L858R) were identified in 12 samples and a mutation of resistance (p.T790M) was detected in 7 samples. The comparison of DNA concentrations isolated by different methods and of the sensitivity of methods for determining mutations of the EGFR gene.