Details

Title: Степень метилирования интрона 1 гена SNCA в CD45+ клетках периферической крови при болезни Паркинсона: выпускная квалификационная работа магистра: направление 16.04.01 «Техническая физика» ; образовательная программа 16.04.01_13 «Медицинская физика»
Creators: Литусова Екатерина Михайловна
Scientific adviser: Богомаз Денис Игоревич; Емельянов Антон Константинович
Other creators: Октябрьский Валерий Павлович
Organization: Санкт-Петербургский политехнический университет Петра Великого. Институт биомедицинских систем и биотехнологий
Imprint: Санкт-Петербург, 2020
Collection: Выпускные квалификационные работы; Общая коллекция
Subjects: болезнь Паркинсона; альфа-синуклеин; метилирование ДНК; SNCA; дофамин; лимфоциты периферической крови; CD45+; Parkinson's disease; alfa-synuclein; DNA methylation; dopamine; peripheral blood lymphocytes
Document type: Master graduation qualification work
File type: PDF
Language: Russian
Level of education: Master
Speciality code (FGOS): 16.04.01
Speciality group (FGOS): 160000 - Физико-технические науки и технологии
Links: Отзыв руководителя; Рецензия; Отчет о проверке на объем и корректность внешних заимствований
DOI: 10.18720/SPBPU/3/2020/vr/vr20-1063
Rights: Доступ по паролю из сети Интернет (чтение)
Record key: ru\spstu\vkr\9164

Allowed Actions:

Action 'Read' will be available if you login or access site from another network

Group: Anonymous

Network: Internet

Annotation

Ключевым звеном патогенеза болезни Паркинсона (БП) является олигомеризация небольшого пресинаптического белка альфа-синуклеина (SNCA) в цитоплазме дофаминергических нейронов черной субстанции головного мозга. Предполагается, что на агрегацию белка может влиять нарушение эпигенетической регуляции экспрессии гена SNCA, в том числе за счет воздействия дофамина (ДА). В данной работе оценивалась степень метилирования интрона 1 гена SNCA и уровень его экспрессии в CD45+ клетках пациентов с БП и индивидуумов контрольной группы, а также влияние ДА на данные показатели в указанных группах in vitro. Оценка степени метилирования интрона 1 гена SNCA и уровня его экспрессии проводилась с помощью массового параллельного секвенирования бисульфит-конвертированной ДНК и ПЦР в режиме реального времени, соответственно. В результате исследования обнаружено снижение степени метилирования интрона 1 гена SNCA в культивируемых без ДА лимфоцитах периферической крови (ЛПК) пациентов с БП по сравнению с контролем. Выявлено, что ДА не влияет на степень метилирования интрона 1 гена SNCA в культивируемых ЛПК как пациентов с БП, так и индивидуумов контрольной группы. В то же время не было обнаружено ассоциации БП с изменением степени метилирования интрона 1 гена SNCA в CD45+ клетках. Выявлено изменение степени метилирования отдельных CpG-островков интрона 1 гена SNCA при БП как в CD45+ клетках, так и в культивируемых ЛПК. Полученные данные свидетельствуют об отсутствии ассоциации степени метилирования интрона 1 гена SNCA в CD45+ клетках периферической крови и БП, а также влияния ДА на степень метилирования указанной области данного гена при БП in vitro.

It’s known that the key link in the pathogenesis of Parkinson's disease (PD) is the oligomerization of a small presynaptic alpha-synuclein protein (SNCA) in the cytoplasm of dopaminergic neurons of the substantia nigra. It’s assumed that protein aggregation can be affected by a violation of the epigenetic regulation of SNCA gene expression, including due to exposure to dopamine (DA). In this work, we evaluated the methylation status of of SNCA-intron1 and its expression level in CD45 + cells of patients with PD and control individuals, as well as the effect of DA on these parameters in these groups in vitro. Real-time polymerase chain reaction was used to measure of the SNCA gene expression. Methylation state of SNCA-intron1 was analyzed using high-resolution bisulphite sequencing. As a result of the study, a decrease in the methylation status of SNCA-intron1 in the cultured without DA peripheral blood lymphocytes (PBL) of patients with PD was found compared with the control. It was revealed that DA doesn’t affect the methylation status of SNCA-intron1 in cultured PBL both in patients with PD and in individuals of the control group. At the same time, there was no association of PD with a change in the methylation status of SNCA-intron1 in CD45 + cells. A change was detected in methylation status of individual CpG islands of SNCA-intron1 in PD both in CD45 + cells and in cultured PBL. The data obtained indicate the absence of association of the methylation status of SNCA-intron1 in CD45 + cells of peripheral blood and PD, as well as the effect of DA on the methylation status of this region of this gene in PD in vitro.

Document access rights

Network User group Action
ILC SPbPU Local Network All Read
Internet Authorized users SPbPU Read
-> Internet Anonymous

Usage statistics

stat Access count: 1
Last 30 days: 0
Detailed usage statistics